38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2729 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  100 
 
 		 1141 aa  2331    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  68.89 
 
 		 1140 aa  1626    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1138 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1159 aa  312  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  27.41 
 
 		 1159 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1145 aa  287  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  24.64 
 
 		 1109 aa  213  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  24.98 
 
 		 1207 aa  201  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  24.02 
 
 		 1159 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  21.25 
 
 		 1113 aa  176  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  25.16 
 
 		 1107 aa  164  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1159 aa  158  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  23.92 
 
 		 1093 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1214 aa  77  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1122 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  21.06 
 
 		 1121 aa  64.3  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  23.63 
 
 		 1228 aa  60.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1121 aa  57.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  24.39 
 
 		 1140 aa  54.3  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1151 aa  53.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1121 aa  52  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1123 aa  51.6  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1143 aa  50.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1144 aa  50.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1166 aa  50.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  28.68 
 
 		 1124 aa  49.7  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1121 aa  49.7  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1125 aa  49.7  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1114 aa  49.3  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1045 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1121 aa  48.9  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  27.88 
 
 		 979 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  27.82 
 
 		 1130 aa  47.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1121 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1354 aa  46.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  26.21 
 
 		 406 aa  45.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  23.2 
 
 		 1133 aa  45.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1128 aa  45.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>