34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3062 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  68.89 
 
 		 1141 aa  1610    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  100 
 
 		 1140 aa  2351    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1138 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  27.26 
 
 		 1159 aa  308  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1159 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  24.12 
 
 		 1109 aa  213  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  24.64 
 
 		 1207 aa  207  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  25.19 
 
 		 1159 aa  205  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  21.28 
 
 		 1113 aa  184  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1159 aa  182  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  22.07 
 
 		 1107 aa  159  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  33.57 
 
 		 1145 aa  146  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  23.4 
 
 		 1228 aa  129  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1214 aa  94.7  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  23.95 
 
 		 1093 aa  90.9  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1122 aa  89.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1121 aa  75.5  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  20.87 
 
 		 1125 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1125 aa  73.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  21.02 
 
 		 1121 aa  69.3  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1121 aa  65.1  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1121 aa  64.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1151 aa  57.4  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  23.01 
 
 		 1140 aa  53.5  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  25.5 
 
 		 1130 aa  52  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1045 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  28 
 
 		 1166 aa  50.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  28.31 
 
 		 979 aa  49.7  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1143 aa  49.3  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1144 aa  49.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1123 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1114 aa  47.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  23.61 
 
 		 1133 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1121 aa  44.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>