17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0895 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0895  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011198  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  84.78 
 
 
1125 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  80.43 
 
 
1121 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  82.61 
 
 
1121 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  80.43 
 
 
1121 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  73.91 
 
 
1121 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  71.74 
 
 
1122 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  69.57 
 
 
1121 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  67.57 
 
 
1140 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  69.44 
 
 
1133 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  64.86 
 
 
1124 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  62.16 
 
 
1143 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  62.16 
 
 
1144 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  64.71 
 
 
1130 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  64.71 
 
 
1125 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  55.88 
 
 
1166 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  51.61 
 
 
1123 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>