More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1198 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  100 
 
 		 291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  60.76 
 
 		 292 aa  360  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  57.79 
 
 		 291 aa  328  9e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  54.11 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  53.42 
 
 		 294 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  54.45 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  52.74 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  52.4 
 
 		 295 aa  271  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  52.4 
 
 		 295 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  52.4 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  52.05 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  52.05 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  52.05 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  52.05 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  52.05 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  51.71 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  51.71 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  51.2 
 
 		 293 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  51.2 
 
 		 293 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  45.33 
 
 		 289 aa  244  9e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  45.02 
 
 		 293 aa  241  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  45.9 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  45.52 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  45.7 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  47.16 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  45.39 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  47.26 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  43.96 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  45.82 
 
 		 291 aa  231  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  48.08 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  48.08 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  45.19 
 
 		 310 aa  228  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  44.56 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.48 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  42.76 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 292 aa  224  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  45.67 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  45.67 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  46.29 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  45.67 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  45.27 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  46.29 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  46.29 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  46.29 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  46.29 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  46.29 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  46.29 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  46.29 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  45.96 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  45.96 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  46.85 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  46.85 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  42.76 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  47.55 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  41.79 
 
 		 292 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  43.67 
 
 		 346 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  45.94 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  41.19 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  45.61 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  45.61 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  47.35 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  40.95 
 
 		 341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  44.91 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  46.44 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  45.61 
 
 		 293 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  46.07 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  44.67 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  45.8 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  45.61 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  44.22 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  44.88 
 
 		 293 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.3 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  42.47 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  45.2 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  47.2 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  44.25 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  44.56 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  47 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  42.96 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  42.36 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.67 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  42.12 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>