More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0347 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 
299 aa  598  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  48.03 
 
 
294 aa  256  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  46.64 
 
 
293 aa  252  5.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  45.45 
 
 
285 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  45.97 
 
 
289 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  45.87 
 
 
295 aa  246  4e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  46.42 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  42.27 
 
 
283 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  42.27 
 
 
283 aa  232  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  41.92 
 
 
283 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.27 
 
 
283 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  44.56 
 
 
290 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  41.58 
 
 
283 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  44.22 
 
 
290 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.88 
 
 
290 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  41.58 
 
 
283 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  41.58 
 
 
283 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.88 
 
 
290 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  41.58 
 
 
283 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  46.26 
 
 
290 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  44.98 
 
 
256 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  45.58 
 
 
290 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  44.98 
 
 
256 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  41.78 
 
 
290 aa  222  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  42.12 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  44.9 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.47 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  45.24 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  44.22 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  42.18 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.48 
 
 
282 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  40.2 
 
 
307 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  44.22 
 
 
290 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.07 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  39.86 
 
 
282 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40.13 
 
 
294 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.24 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.24 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  40.75 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  40.41 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.46 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  38.46 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  40.45 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  41.54 
 
 
278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  41.54 
 
 
278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  40.48 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  41.83 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  40.75 
 
 
300 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  40.82 
 
 
295 aa  209  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  40.88 
 
 
307 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  42.18 
 
 
295 aa  208  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  41.58 
 
 
298 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  38.38 
 
 
298 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  42.3 
 
 
296 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  41.1 
 
 
286 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.46 
 
 
286 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40.2 
 
 
302 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.92 
 
 
269 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  39.6 
 
 
284 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  41.84 
 
 
292 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  41.84 
 
 
292 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  41.84 
 
 
292 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  41.84 
 
 
292 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  41.1 
 
 
292 aa  205  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  38.16 
 
 
310 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  41.08 
 
 
294 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  39.46 
 
 
288 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  41.16 
 
 
292 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  38.98 
 
 
279 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  39.8 
 
 
295 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  41.41 
 
 
298 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  41 
 
 
292 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  38.98 
 
 
279 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  42.57 
 
 
292 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  41.78 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  42.57 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  42.23 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  41.22 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  39.47 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  42.57 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  39.45 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  39.27 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  40.82 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  39.19 
 
 
294 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.09 
 
 
323 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  42.58 
 
 
333 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  41.31 
 
 
301 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  38.85 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  38.78 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  39.39 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  43.29 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  38.21 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  39.32 
 
 
294 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  38.96 
 
 
314 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  41.54 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  38.18 
 
 
282 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  40.13 
 
 
303 aa  195  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  38.96 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  40.48 
 
 
286 aa  195  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  39.34 
 
 
319 aa  195  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>