174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t0565 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0005  tRNA-Met  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04040  tRNA-Val  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0023  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00191996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0012  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  90.38 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  87.93 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1753  tRNA-OTHER  94.12 
 
 		 61 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0016922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0668  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1863  tRNA-Met  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000158589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0119  tRNA-Met  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0115  tRNA-Met  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.791558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1788  tRNA-Met  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0390  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5647  tRNA-Asx  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5705  tRNA-Asx  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  85.45 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  85.45 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000687099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000965695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0026  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000025046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0031  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000375909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0078  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07709  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0523717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0031  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000435649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0078  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0042  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0763  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.366453  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1414  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.906421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>