More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0010 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  55.32 
 
 
191 aa  226  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  57.45 
 
 
189 aa  226  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  53.23 
 
 
207 aa  203  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  53.23 
 
 
207 aa  202  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  53.23 
 
 
186 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  53.23 
 
 
186 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  53.23 
 
 
186 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  52.69 
 
 
207 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  52.69 
 
 
207 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  52.69 
 
 
210 aa  201  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  52.69 
 
 
186 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  52.15 
 
 
207 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  52.15 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 
186 aa  194  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 
186 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
185 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 
191 aa  177  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
187 aa  175  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  48.92 
 
 
186 aa  169  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
190 aa  168  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 
190 aa  167  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 
188 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
190 aa  167  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
190 aa  167  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 
188 aa  167  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
183 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 
189 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  43.92 
 
 
189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 
190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 
210 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 
201 aa  158  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 
188 aa  157  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 
196 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
186 aa  156  2e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  43.92 
 
 
189 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
185 aa  156  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 
184 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.61 
 
 
206 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
219 aa  154  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  45.5 
 
 
189 aa  154  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
190 aa  153  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 
213 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 
206 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 
193 aa  151  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 
206 aa  151  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
208 aa  151  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 
186 aa  150  8e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 
213 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
195 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 
214 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 
189 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 
207 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 
181 aa  149  3e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 
187 aa  147  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  38.66 
 
 
209 aa  147  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
217 aa  147  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 
186 aa  147  9e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
230 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  39.55 
 
 
206 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
193 aa  145  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 
188 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  39.43 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 
193 aa  144  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  44.65 
 
 
202 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 
365 aa  144  9e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  44.03 
 
 
202 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 
187 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 
194 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
191 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 
206 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  37.97 
 
 
192 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
180 aa  142  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 
195 aa  141  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
191 aa  140  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0398  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  42.01 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 
191 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  42.29 
 
 
191 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  36.26 
 
 
213 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 
199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 
213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>