More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25950 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  100 
 
 
796 aa  1564    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  67.34 
 
 
1202 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  67.44 
 
 
1078 aa  561  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  71.23 
 
 
841 aa  551  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.12 
 
 
878 aa  548  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  69.27 
 
 
863 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  67.86 
 
 
1122 aa  524  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.81 
 
 
637 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.51 
 
 
715 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.63 
 
 
732 aa  521  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.42 
 
 
729 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  63.88 
 
 
1159 aa  516  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.22 
 
 
926 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.07 
 
 
834 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  66.67 
 
 
872 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.08 
 
 
743 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.1 
 
 
692 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  63.97 
 
 
727 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  67.1 
 
 
808 aa  509  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.06 
 
 
855 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.82 
 
 
872 aa  498  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.06 
 
 
774 aa  495  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.8 
 
 
812 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.77 
 
 
678 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.1 
 
 
690 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  57.18 
 
 
737 aa  485  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  60.44 
 
 
801 aa  478  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  56.11 
 
 
578 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.21 
 
 
652 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  55.84 
 
 
690 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.45 
 
 
960 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.21 
 
 
616 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.21 
 
 
616 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  58.85 
 
 
643 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.21 
 
 
618 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  42.17 
 
 
582 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.85 
 
 
569 aa  310  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.97 
 
 
582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.52 
 
 
579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.01 
 
 
589 aa  304  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.47 
 
 
562 aa  300  7e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.73 
 
 
561 aa  300  8e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.72 
 
 
551 aa  298  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.56 
 
 
562 aa  297  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.04 
 
 
562 aa  297  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.04 
 
 
562 aa  296  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  40.66 
 
 
579 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  40.65 
 
 
396 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.78 
 
 
562 aa  295  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.78 
 
 
562 aa  295  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.78 
 
 
562 aa  295  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.46 
 
 
562 aa  294  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.52 
 
 
562 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.52 
 
 
562 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.52 
 
 
562 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.8 
 
 
588 aa  293  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.06 
 
 
559 aa  292  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.68 
 
 
518 aa  291  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  41.27 
 
 
652 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.3 
 
 
602 aa  288  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.32 
 
 
599 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.7 
 
 
518 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  39.01 
 
 
900 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.34 
 
 
632 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.3 
 
 
397 aa  283  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  40.38 
 
 
396 aa  281  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.86 
 
 
649 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.95 
 
 
582 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.69 
 
 
550 aa  281  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.9 
 
 
606 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.62 
 
 
579 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.33 
 
 
427 aa  279  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.02 
 
 
567 aa  278  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.73 
 
 
735 aa  278  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.39 
 
 
570 aa  277  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.02 
 
 
401 aa  276  7e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.57 
 
 
527 aa  277  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.57 
 
 
755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.14 
 
 
550 aa  275  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.14 
 
 
554 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.16 
 
 
611 aa  274  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.67 
 
 
644 aa  274  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.15 
 
 
612 aa  273  8.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.48 
 
 
617 aa  273  9e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.13 
 
 
398 aa  273  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.11 
 
 
690 aa  272  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.37 
 
 
601 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.16 
 
 
520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  41.78 
 
 
648 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.37 
 
 
601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.83 
 
 
575 aa  271  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.55 
 
 
685 aa  270  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.72 
 
 
554 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 
625 aa  270  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.84 
 
 
610 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.4 
 
 
591 aa  269  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.63 
 
 
606 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.42 
 
 
613 aa  267  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  37.57 
 
 
584 aa  267  7e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.08 
 
 
447 aa  266  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>