More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00140 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  100 
 
 
172 aa  352  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  62.57 
 
 
179 aa  221  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  62.07 
 
 
178 aa  217  8e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  69.59 
 
 
177 aa  216  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  64.5 
 
 
181 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  61.4 
 
 
173 aa  207  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  63.31 
 
 
187 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  62.5 
 
 
178 aa  205  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  65.48 
 
 
177 aa  204  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  62.13 
 
 
181 aa  205  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.77678e-13 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  61.58 
 
 
179 aa  204  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  61.27 
 
 
181 aa  201  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  61.99 
 
 
176 aa  200  8e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  65.48 
 
 
170 aa  199  2e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  63.69 
 
 
179 aa  195  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  65.54 
 
 
184 aa  195  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  62.43 
 
 
193 aa  193  8e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  64.5 
 
 
175 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  64.5 
 
 
175 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  64.5 
 
 
175 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  58.08 
 
 
176 aa  188  3e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  63.13 
 
 
179 aa  188  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  64.88 
 
 
173 aa  187  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  62.57 
 
 
178 aa  184  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  57.06 
 
 
175 aa  182  2e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  62.13 
 
 
182 aa  182  2e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  63.16 
 
 
182 aa  181  4e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  64.12 
 
 
170 aa  181  4e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  58.08 
 
 
174 aa  180  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  58.72 
 
 
206 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  56.29 
 
 
188 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  56.29 
 
 
188 aa  178  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  57.06 
 
 
175 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  59.77 
 
 
189 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  61.31 
 
 
177 aa  175  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  55.09 
 
 
174 aa  172  3e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  59.52 
 
 
176 aa  171  4e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  60.12 
 
 
182 aa  171  4e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  51.37 
 
 
201 aa  171  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  58.24 
 
 
176 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  59.52 
 
 
182 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  52.35 
 
 
172 aa  169  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  58.24 
 
 
176 aa  161  5e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  51.18 
 
 
172 aa  160  8e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  58.24 
 
 
180 aa  158  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  49.11 
 
 
287 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
241 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  51.18 
 
 
176 aa  152  3e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  49.1 
 
 
266 aa  151  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.66 
 
 
310 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  50 
 
 
657 aa  149  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  46.78 
 
 
571 aa  148  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.47 
 
 
310 aa  148  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.59 
 
 
376 aa  142  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.17 
 
 
310 aa  140  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.09 
 
 
378 aa  140  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  55.81 
 
 
228 aa  140  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  57.93 
 
 
168 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  44.71 
 
 
629 aa  137  9e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.79 
 
 
357 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  56.1 
 
 
168 aa  134  7e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  45.56 
 
 
665 aa  132  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  54.49 
 
 
168 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  45.09 
 
 
174 aa  131  4e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  54.88 
 
 
168 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  45.66 
 
 
178 aa  129  2e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  51.72 
 
 
164 aa  127  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  51.72 
 
 
164 aa  126  1e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.97 
 
 
202 aa  126  1e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.57 
 
 
372 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  42.44 
 
 
533 aa  125  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  45.11 
 
 
181 aa  124  4e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  47.06 
 
 
629 aa  124  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  45.68 
 
 
172 aa  124  8e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.5 
 
 
468 aa  123  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50 
 
 
164 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  46.86 
 
 
573 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  44.26 
 
 
179 aa  121  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  58.33 
 
 
322 aa  121  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  51.03 
 
 
163 aa  121  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  53.06 
 
 
167 aa  120  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
376 aa  120  1e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40 
 
 
160 aa  120  1e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  46.21 
 
 
254 aa  119  2e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.98862e-05 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  46.71 
 
 
254 aa  119  2e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.51 
 
 
196 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  47.95 
 
 
161 aa  118  4e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  44.57 
 
 
181 aa  117  5e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  50.68 
 
 
197 aa  117  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  49.66 
 
 
141 aa  117  1e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  47.24 
 
 
372 aa  116  1e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  41.76 
 
 
156 aa  115  2e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  48.28 
 
 
141 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.7 
 
 
195 aa  113  2e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.89 
 
 
466 aa  112  2e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1769  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.63 
 
 
141 aa  112  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00430  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  46.06 
 
 
375 aa  112  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15577  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  45.18 
 
 
222 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04467  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B Precursor (PPIase B)(Rotamase B)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4R3]  45.73 
 
 
214 aa  112  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.497778  normal  0.168508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2344  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.33 
 
 
139 aa  111  4e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>