37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2503 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  100 
 
 
263 aa  508  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  73.73 
 
 
269 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  61.51 
 
 
282 aa  311  4.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  56.93 
 
 
293 aa  294  9e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  52.26 
 
 
256 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  52.63 
 
 
256 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  53.69 
 
 
255 aa  247  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  51.37 
 
 
260 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  58.02 
 
 
242 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  52.07 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  49.37 
 
 
267 aa  208  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  49.26 
 
 
295 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  49.79 
 
 
273 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  48.58 
 
 
258 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  48.22 
 
 
269 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  48.78 
 
 
437 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  44.68 
 
 
277 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  46.91 
 
 
286 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  46.69 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  44.21 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  43.04 
 
 
241 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  42.11 
 
 
256 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  45.97 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  42.45 
 
 
255 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  43.32 
 
 
268 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  45.68 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  41.2 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  41.91 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  41.04 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  42.15 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  42.15 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  37.68 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  41.6 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  41.6 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  37.63 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  29.82 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1923  abortive infection protein  33.73 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>