57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2454 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2454  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 332 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00561279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35740  von Willebrand factor type A-like protein  43.73 
 
 		 341 aa  245  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3961  von Willebrand factor type A  42.14 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  40.06 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3079  von Willebrand factor type A  36.31 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0708582  hitchhiker  0.000000341622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  40.09 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2370  von Willebrand factor, type A  38.15 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  28.87 
 
 		 371 aa  125  9e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1985  hypothetical protein  28.94 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0043  hypothetical protein  29.27 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  27.81 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  30.82 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  29.27 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  23.76 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0875  hypothetical protein  38.36 
 
 		 302 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134729  normal  0.367408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  29.93 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  23.49 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  23.11 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.69 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  28.31 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  22.77 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  29.93 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  25.11 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  22.35 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  23.98 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  30.33 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  23.88 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  24.06 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 1188 aa  46.2  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  30.89 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  23.98 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  24.73 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  28.73 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  22.97 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  28.99 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  28.8 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  23.84 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  23.87 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.87 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  27.7 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  24.69 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  30.71 
 
 		 412 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>