More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1996 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 518 aa  1003    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.13 
 
 		 517 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.16 
 
 		 491 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  63.04 
 
 		 494 aa  578  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  62.27 
 
 		 484 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.66 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  61.34 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.78 
 
 		 491 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.51 
 
 		 506 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  58.06 
 
 		 502 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  53.94 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.23 
 
 		 480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.83 
 
 		 481 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  50.48 
 
 		 493 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.41 
 
 		 491 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  52.11 
 
 		 488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.33 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.86 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.51 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.61 
 
 		 521 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.3 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.18 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.82 
 
 		 479 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.4 
 
 		 507 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.02 
 
 		 486 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.14 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.59 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.76 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.77 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  50.1 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.75 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.57 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.57 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.57 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.6 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.69 
 
 		 465 aa  363  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.04 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  44 
 
 		 460 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  43.09 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.67 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.87 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  37.22 
 
 		 437 aa  299  8e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.2 
 
 		 440 aa  299  9e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.39 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.59 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.14 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.31 
 
 		 437 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.12 
 
 		 438 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  37.3 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.4 
 
 		 452 aa  277  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  36.68 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.27 
 
 		 444 aa  273  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.55 
 
 		 446 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.27 
 
 		 444 aa  273  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  36.27 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  37.76 
 
 		 428 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.96 
 
 		 463 aa  270  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  35.6 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.33 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.65 
 
 		 431 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.02 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.94 
 
 		 462 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.49 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  36.42 
 
 		 458 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.31 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.93 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.8 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  35.52 
 
 		 430 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.25 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.57 
 
 		 431 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.95 
 
 		 431 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.81 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.17 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.99 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.46 
 
 		 431 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.79 
 
 		 433 aa  256  8e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  35.2 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.4 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.69 
 
 		 441 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  33.8 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  35.4 
 
 		 431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.02 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2917  hypothetical protein  36.65 
 
 		 482 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.84 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2977  hypothetical protein  36.65 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0462  xanthine/uracil permease family protein  36.65 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3022  xanthine/uracil permease family protein  36.65 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0167  hypothetical protein  36.65 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0980  hypothetical protein  36.65 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2608  hypothetical protein  36.65 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  34.65 
 
 		 445 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  34.46 
 
 		 445 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  34.65 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  34.7 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  34.65 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  34.7 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.44 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.7 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  34.21 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  35.2 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>