More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2229 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2229  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0705013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0593  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.14 
 
 
164 aa  191  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3526  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.56 
 
 
144 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1132  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.28 
 
 
149 aa  189  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2503  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  56.83 
 
 
157 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1100  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  59.7 
 
 
141 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1622  ech hydrogenase subunit C  56.74 
 
 
144 aa  170  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0673  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.79 
 
 
146 aa  170  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1520  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  54.68 
 
 
157 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0362  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  61.11 
 
 
160 aa  169  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.547425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0551  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  54.35 
 
 
143 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3369  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  52.05 
 
 
149 aa  167  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0026  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  50.3 
 
 
163 aa  166  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1671  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  55.64 
 
 
185 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1732  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  53.96 
 
 
144 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00966661  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0957  membrane bound hydrogenase subunit mbhJ  53.52 
 
 
143 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0013552  normal  0.515096 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2588  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  57.97 
 
 
145 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13360  ech hydrogenase subunit C  51.43 
 
 
146 aa  164  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2726  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  52.82 
 
 
147 aa  164  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0851861  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0150  ech hydrogenase subunit C  55.56 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3022  ech hydrogenase subunit C  51.45 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.678569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1084  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  53.38 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00491903  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0780  ech hydrogenase subunit C  58.4 
 
 
155 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4116  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  52.55 
 
 
338 aa  160  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2455  ech hydrogenase subunit C  51.72 
 
 
163 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0152532  normal  0.126862 
 
 
-
 
NC_002936  DET0862  hydrogenase, group 4, EchC subunit, putative  56.8 
 
 
155 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2651  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  50.69 
 
 
147 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_765  hydrogenase, EchC subunit  56.8 
 
 
155 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1743  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  53.24 
 
 
148 aa  158  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1070  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.28 
 
 
142 aa  158  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0321  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  51.72 
 
 
173 aa  157  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1572  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.3 
 
 
147 aa  155  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.105543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07240  ech hydrogenase subunit C  48.57 
 
 
181 aa  154  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0105522  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1868  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  52 
 
 
274 aa  147  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2783  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  52.46 
 
 
179 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2791  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  52.46 
 
 
179 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0713  hydrogenase-4 component I  50.82 
 
 
274 aa  143  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0121746  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1637  hypothetical protein  50 
 
 
274 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019853  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  49.66 
 
 
174 aa  143  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1212  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50.37 
 
 
156 aa  140  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01010  Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  45.14 
 
 
283 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0706  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.63 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0117  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  49.63 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.729725  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4568  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  45.59 
 
 
246 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  47.18 
 
 
246 aa  136  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.14 
 
 
187 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0125  hydrogenase-Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  46.15 
 
 
271 aa  136  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  44.9 
 
 
250 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  47.18 
 
 
244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  44.44 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3192  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  47.97 
 
 
146 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0772  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  47.41 
 
 
159 aa  135  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  42.67 
 
 
173 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1422  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  46.09 
 
 
142 aa  134  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  46.56 
 
 
211 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1882  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  47.15 
 
 
149 aa  134  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.430184  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  43.07 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
244 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  42.86 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2184  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  42.34 
 
 
252 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.245512 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
244 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1887  NADH dehydrogenase subunit B  43.75 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1278  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.52 
 
 
263 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499713  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  44.44 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  42.66 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  42.66 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  47.14 
 
 
170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  46.56 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4504  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  45.38 
 
 
144 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  43.06 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  43.62 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  45.8 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  45.8 
 
 
174 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  42.36 
 
 
194 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.36 
 
 
191 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  46.56 
 
 
177 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  44.44 
 
 
193 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  42.36 
 
 
194 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  44.44 
 
 
193 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  43.62 
 
 
172 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  45.8 
 
 
174 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  43.75 
 
 
190 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2715  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.18 
 
 
263 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.06 
 
 
176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  43.75 
 
 
195 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  45.07 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
172 aa  131  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
172 aa  131  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4562  NADH dehydrogenase subunit B  42.36 
 
 
194 aa  131  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
172 aa  131  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
172 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  43.75 
 
 
197 aa  131  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
172 aa  131  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.06 
 
 
180 aa  131  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0967  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  46.34 
 
 
144 aa  131  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0599586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>