More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07240 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_07240  ech hydrogenase subunit C  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0105522  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1572  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  79.86 
 
 
147 aa  254  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.105543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13360  ech hydrogenase subunit C  80.56 
 
 
146 aa  250  9.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3022  ech hydrogenase subunit C  71.32 
 
 
145 aa  214  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.678569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1732  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  71.32 
 
 
144 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00966661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2726  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  65.49 
 
 
147 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0851861  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1743  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  65.52 
 
 
148 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1622  ech hydrogenase subunit C  65.97 
 
 
144 aa  210  7.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0362  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  60.9 
 
 
160 aa  210  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.547425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0026  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  59.24 
 
 
163 aa  209  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4116  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  65.94 
 
 
338 aa  206  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3369  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  67.88 
 
 
149 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2651  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  62.59 
 
 
147 aa  198  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1084  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  61.43 
 
 
154 aa  198  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00491903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2503  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  62.59 
 
 
157 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1520  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  63.43 
 
 
157 aa  191  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0551  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  64.93 
 
 
143 aa  190  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1671  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  55.06 
 
 
185 aa  188  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0150  ech hydrogenase subunit C  64.18 
 
 
156 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0862  hydrogenase, group 4, EchC subunit, putative  62.7 
 
 
155 aa  185  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0780  ech hydrogenase subunit C  62.7 
 
 
155 aa  184  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2455  ech hydrogenase subunit C  57.93 
 
 
163 aa  184  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0152532  normal  0.126862 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_765  hydrogenase, EchC subunit  62.7 
 
 
155 aa  184  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1100  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  63.08 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0593  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.97 
 
 
164 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1132  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.85 
 
 
149 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3526  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.71 
 
 
144 aa  158  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2588  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  53.44 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2229  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  48.57 
 
 
183 aa  154  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0705013  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0673  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.85 
 
 
146 aa  152  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0957  membrane bound hydrogenase subunit mbhJ  52.14 
 
 
143 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0013552  normal  0.515096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0321  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  43.48 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1070  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.23 
 
 
142 aa  144  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2783  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  44.08 
 
 
179 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2791  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  44.08 
 
 
179 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4568  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  44.24 
 
 
246 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0713  hydrogenase-4 component I  41.46 
 
 
274 aa  132  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0121746  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1868  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45.04 
 
 
274 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0125  hydrogenase-Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  45.45 
 
 
271 aa  127  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1637  hypothetical protein  38.99 
 
 
274 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1278  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.7 
 
 
263 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499713  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2715  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.3 
 
 
263 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01010  Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  43.94 
 
 
283 aa  125  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1422  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  44.53 
 
 
142 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3192  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.01 
 
 
146 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1882  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.01 
 
 
149 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.430184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3157  formate hydrogenlyase, subunit G  43.94 
 
 
255 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102122 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02569  hydrogenase 3 and formate hydrogenase complex, HycG subunit  41.38 
 
 
255 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0970  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  43.94 
 
 
255 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2844  formate hydrogenlyase, subunit G  41.38 
 
 
255 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0598328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2999  formate hydrogenlyase subunit G  43.94 
 
 
255 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4504  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  42.22 
 
 
144 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3050  formate hydrogenlyase subunit G  43.94 
 
 
255 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3970  formate hydrogenlyase, subunit G  41.38 
 
 
255 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3007  formate hydrogenlyase, subunit G  41.38 
 
 
255 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2968  formate hydrogenlyase, subunit G  43.94 
 
 
255 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2855  formate hydrogenlyase, subunit G  43.94 
 
 
255 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3034  formate hydrogenlyase subunit G  43.94 
 
 
255 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0993  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  43.94 
 
 
255 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0465314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02534  hypothetical protein  41.38 
 
 
255 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3192  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40.69 
 
 
255 aa  121  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0967  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.18 
 
 
144 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2428  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  43.94 
 
 
265 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0377  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.69 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0166282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  46.88 
 
 
266 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2184  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  43.18 
 
 
252 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.245512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2465  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  43.38 
 
 
279 aa  118  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.150245  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3711  hydrogenase-4, I subunit  41.26 
 
 
252 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2636  hydrogenase-4, I subunit  41.26 
 
 
252 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02381  hydrogenase 4, Fe-S subunit  41.26 
 
 
252 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1180  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.26 
 
 
252 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2623  hydrogenase-4, I subunit  41.26 
 
 
252 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2861  hydrogenase-4, I subunit  41.26 
 
 
252 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1187  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.26 
 
 
252 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.274215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02343  hypothetical protein  41.26 
 
 
252 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2771  hydrogenase-4, I subunit  41.26 
 
 
252 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1051  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0181  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  48.48 
 
 
245 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.419402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1604  NADH dehydrogenase subunit B  40.44 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  39.57 
 
 
174 aa  111  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  46.3 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  35.57 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1219  NADH dehydrogenase subunit B  37.04 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  36.42 
 
 
235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.07 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.07 
 
 
170 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
252 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  39.44 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.44 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  37.88 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  39.04 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  35.56 
 
 
170 aa  108  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 
185 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  43.9 
 
 
244 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  43.9 
 
 
246 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  43.12 
 
 
184 aa  108  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.44 
 
 
170 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  37.6 
 
 
184 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0101  NADH dehydrogenase subunit B  34.48 
 
 
205 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  37.76 
 
 
184 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>