More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2726 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2726  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0851861  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0362  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  74.66 
 
 
160 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.547425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0026  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  76.6 
 
 
163 aa  248  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4116  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  73.24 
 
 
338 aa  239  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1743  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  73.24 
 
 
148 aa  235  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1622  ech hydrogenase subunit C  70.63 
 
 
144 aa  234  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1732  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  75.36 
 
 
144 aa  233  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00966661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3022  ech hydrogenase subunit C  68.28 
 
 
145 aa  233  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.678569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1572  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  71.43 
 
 
147 aa  228  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.105543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2651  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  64.83 
 
 
147 aa  219  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13360  ech hydrogenase subunit C  66.43 
 
 
146 aa  216  7.999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1520  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  70.23 
 
 
157 aa  215  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2503  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  70.23 
 
 
157 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07240  ech hydrogenase subunit C  65.49 
 
 
181 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0105522  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3369  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  64.54 
 
 
149 aa  209  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1084  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  63.5 
 
 
154 aa  207  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00491903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1671  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  66.41 
 
 
185 aa  201  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1100  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  68.46 
 
 
141 aa  197  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0150  ech hydrogenase subunit C  65.65 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2455  ech hydrogenase subunit C  61.03 
 
 
163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0152532  normal  0.126862 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0780  ech hydrogenase subunit C  67.46 
 
 
155 aa  194  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0551  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  64.18 
 
 
143 aa  194  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0862  hydrogenase, group 4, EchC subunit, putative  66.67 
 
 
155 aa  192  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_765  hydrogenase, EchC subunit  66.67 
 
 
155 aa  191  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0593  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.36 
 
 
164 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1132  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.15 
 
 
149 aa  176  8e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0673  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.21 
 
 
146 aa  170  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3526  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.59 
 
 
144 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2229  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  52.82 
 
 
183 aa  164  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0705013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2588  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  51.8 
 
 
145 aa  159  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0957  membrane bound hydrogenase subunit mbhJ  53.03 
 
 
143 aa  157  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0013552  normal  0.515096 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1070  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50 
 
 
142 aa  157  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0321  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  45.14 
 
 
173 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1422  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  51.54 
 
 
142 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1868  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  42.55 
 
 
274 aa  142  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0713  hydrogenase-4 component I  43.36 
 
 
274 aa  140  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0121746  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1637  hypothetical protein  45.86 
 
 
274 aa  140  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4504  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  47.45 
 
 
144 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1882  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.62 
 
 
149 aa  140  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.430184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3192  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  47.83 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0125  hydrogenase-Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  42.11 
 
 
271 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02569  hydrogenase 3 and formate hydrogenase complex, HycG subunit  41.67 
 
 
255 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0970  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.67 
 
 
255 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0993  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.67 
 
 
255 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0465314 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2855  formate hydrogenlyase, subunit G  41.67 
 
 
255 aa  134  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3970  formate hydrogenlyase, subunit G  41.67 
 
 
255 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02534  hypothetical protein  41.67 
 
 
255 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4568  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.18 
 
 
246 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3007  formate hydrogenlyase, subunit G  41.67 
 
 
255 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2844  formate hydrogenlyase, subunit G  41.67 
 
 
255 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0598328 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01010  Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  43.61 
 
 
283 aa  134  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3157  formate hydrogenlyase, subunit G  42.86 
 
 
255 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102122 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3050  formate hydrogenlyase subunit G  42.86 
 
 
255 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2968  formate hydrogenlyase, subunit G  42.86 
 
 
255 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3034  formate hydrogenlyase subunit G  42.86 
 
 
255 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2999  formate hydrogenlyase subunit G  42.86 
 
 
255 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0967  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  45.11 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2783  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  45.04 
 
 
179 aa  133  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2791  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  45.04 
 
 
179 aa  133  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3192  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.18 
 
 
255 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1278  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.35 
 
 
263 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499713  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2715  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.35 
 
 
263 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2465  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  42.96 
 
 
279 aa  130  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.150245  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2428  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.6 
 
 
265 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1212  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50.41 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0117  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  50.41 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.729725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2184  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40.74 
 
 
252 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.245512 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0706  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50.41 
 
 
156 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  46.88 
 
 
266 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.21 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  45.07 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  45.8 
 
 
182 aa  124  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0181  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  48.53 
 
 
245 aa  125  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.419402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0796  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  42.97 
 
 
236 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1180  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.59 
 
 
252 aa  124  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3711  hydrogenase-4, I subunit  37.59 
 
 
252 aa  123  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2771  hydrogenase-4, I subunit  37.59 
 
 
252 aa  124  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2861  hydrogenase-4, I subunit  37.59 
 
 
252 aa  123  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2636  hydrogenase-4, I subunit  37.59 
 
 
252 aa  124  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1265  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.79 
 
 
177 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.181899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02381  hydrogenase 4, Fe-S subunit  37.59 
 
 
252 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02343  hypothetical protein  37.59 
 
 
252 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1187  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.59 
 
 
252 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.274215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2623  hydrogenase-4, I subunit  37.59 
 
 
252 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0772  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45.53 
 
 
159 aa  123  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  44.88 
 
 
184 aa  123  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  51.38 
 
 
183 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  43.48 
 
 
174 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  50.46 
 
 
183 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0377  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.94 
 
 
180 aa  120  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0166282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.54 
 
 
226 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  44.2 
 
 
181 aa  120  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  48.62 
 
 
264 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  48.62 
 
 
185 aa  120  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0938  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.72 
 
 
246 aa  120  7e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.358765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3850  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.04 
 
 
177 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100692  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  49.54 
 
 
199 aa  120  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  41.3 
 
 
183 aa  120  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.98 
 
 
183 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  45.45 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>