40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19710 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 193 aa  374  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  29.5 
 
 		 830 aa  89.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 405 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.44 
 
 		 409 aa  81.3  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  30.97 
 
 		 775 aa  77.4  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  30.43 
 
 		 395 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.37 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.74 
 
 		 397 aa  67.8  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 394 aa  62  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.67 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.86 
 
 		 398 aa  54.7  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  25 
 
 		 397 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  23.74 
 
 		 394 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 405 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  23.81 
 
 		 394 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 381 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  23.81 
 
 		 394 aa  45.1  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  41.79 
 
 		 369 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  35.85 
 
 		 378 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  37.74 
 
 		 368 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  37.74 
 
 		 368 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  37.74 
 
 		 368 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  37.74 
 
 		 368 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  37.74 
 
 		 368 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  37.74 
 
 		 368 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  37.74 
 
 		 368 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  37.74 
 
 		 368 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.74 
 
 		 368 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  37.74 
 
 		 368 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 368 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  37.74 
 
 		 368 aa  42  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  37.74 
 
 		 368 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  30.51 
 
 		 370 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 368 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 		 382 aa  41.2  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  26.79 
 
 		 378 aa  41.2  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>