26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13700 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  100 
 
 
140 aa  280  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  57.14 
 
 
139 aa  156  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 
135 aa  94  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  34.07 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  34.62 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  33.58 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  33.61 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  33.82 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  31.85 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  36.57 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  30.83 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  27.34 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  29.41 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  31.2 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  27.14 
 
 
154 aa  53.9  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  21.37 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0978  PilT domain-containing protein  31.43 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.217375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  29.93 
 
 
306 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  23.73 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  23.53 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0266  hypothetical protein  23.87 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.041266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  24.65 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  24.26 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>