276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05600 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  100 
 
 
57 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  78 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
65 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  64.15 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  61.54 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  58.93 
 
 
65 aa  67  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  72.34 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  72.34 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  64.15 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  61.4 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  71.43 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  58.93 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  54.39 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  64 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  52.63 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  52.63 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  58.93 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  62 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  59.65 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  59.65 
 
 
63 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  60.42 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  60.38 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  56.86 
 
 
65 aa  60.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  60.71 
 
 
65 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  55.36 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  66 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  55.36 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  52.83 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  58 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  54.39 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  60.71 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  52.63 
 
 
66 aa  58.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  58 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  68.18 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  54 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  50.88 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  63.04 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  63.04 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  50.88 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  52.83 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  48.21 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  54.39 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  50.88 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  54.72 
 
 
94 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  56.6 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  54 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  63.64 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  50.88 
 
 
64 aa  53.9  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  50.88 
 
 
66 aa  53.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  49.06 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  50.88 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  52.83 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  52.83 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  58 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  58 
 
 
65 aa  52.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  52 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  50.88 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  52.63 
 
 
64 aa  52  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  50.88 
 
 
65 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  50.98 
 
 
65 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  48.08 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  50.94 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  50.88 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  55.1 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  51.92 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0241  50S ribosomal protein L35  51.79 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  47.37 
 
 
66 aa  50.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  52.83 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  54.39 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  54.39 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  59.62 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  51.92 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  53.57 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  51.79 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  50.88 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0034  50S ribosomal protein L35  51.79 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>