More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2351 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
297 aa  611  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  53.9 
 
 
288 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  55.91 
 
 
289 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  54.77 
 
 
289 aa  300  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  50.35 
 
 
288 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  51.92 
 
 
298 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  51.77 
 
 
286 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  50.88 
 
 
296 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  48.79 
 
 
301 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  50.35 
 
 
288 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  52.31 
 
 
286 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  51.06 
 
 
286 aa  288  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  51.76 
 
 
287 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  49.11 
 
 
297 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  49.65 
 
 
312 aa  285  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  49.11 
 
 
303 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  45.91 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  49.82 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  49.65 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  51.94 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  49.47 
 
 
303 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  49.65 
 
 
308 aa  281  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  49.83 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  48.58 
 
 
288 aa  281  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  47.87 
 
 
302 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  51.94 
 
 
315 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  47.52 
 
 
290 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  48.77 
 
 
293 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2013  beta-lactamase domain protein  48.94 
 
 
286 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439251  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  49.29 
 
 
286 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  52.13 
 
 
297 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  48.43 
 
 
294 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  48.04 
 
 
307 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  49.13 
 
 
294 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  48.75 
 
 
296 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.74 
 
 
294 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  50.17 
 
 
294 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  46.81 
 
 
293 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  48.23 
 
 
306 aa  275  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  48.25 
 
 
298 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  48.43 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  49.48 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  49.48 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  48.63 
 
 
298 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  48.08 
 
 
289 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  47.3 
 
 
297 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  47.78 
 
 
300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  48.94 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  48.08 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  47.78 
 
 
307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  48.08 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  48.43 
 
 
294 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  47.78 
 
 
294 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  48.76 
 
 
293 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  48.39 
 
 
288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.06 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  47.39 
 
 
294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  47.39 
 
 
289 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  46.4 
 
 
295 aa  268  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  48.94 
 
 
286 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  45.94 
 
 
288 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  49.15 
 
 
299 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  47.35 
 
 
300 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  47.35 
 
 
300 aa  265  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  46.26 
 
 
432 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  45.68 
 
 
295 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  46.88 
 
 
310 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  46.74 
 
 
319 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  48.07 
 
 
308 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  44.91 
 
 
289 aa  260  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  47.52 
 
 
320 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  46.1 
 
 
426 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  46.1 
 
 
296 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  44.68 
 
 
307 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  43.97 
 
 
294 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  46.62 
 
 
293 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  47.7 
 
 
308 aa  255  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  44.48 
 
 
294 aa  254  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.86 
 
 
299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  44.33 
 
 
287 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  46.79 
 
 
304 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  44.84 
 
 
426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  44.13 
 
 
297 aa  251  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3688  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  45.23 
 
 
295 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  44.13 
 
 
297 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  45.55 
 
 
431 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6795  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  46.1 
 
 
297 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  42.96 
 
 
287 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  42.46 
 
 
290 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.1 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  44.68 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  42.81 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  44.44 
 
 
290 aa  242  5e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  43.62 
 
 
288 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  44.78 
 
 
266 aa  225  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3205  beta-lactamase domain-containing protein  45.26 
 
 
290 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568485  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1978  beta-lactamase domain-containing protein  40.85 
 
 
288 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02317  beta-lactamase  44.83 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.914825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  37.46 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01826  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00340)  41.02 
 
 
407 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>