273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1378 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
436 aa  889    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  42.04 
 
 
489 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.07 
 
 
375 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  43.07 
 
 
509 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  43.07 
 
 
509 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  44 
 
 
466 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  46.84 
 
 
464 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  36.89 
 
 
546 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  41.03 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  38.44 
 
 
506 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  38.36 
 
 
552 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  38.21 
 
 
499 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  38.91 
 
 
498 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  36.99 
 
 
523 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  55.17 
 
 
547 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  38.46 
 
 
499 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  37.68 
 
 
512 aa  187  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  37.68 
 
 
512 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  37.68 
 
 
512 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.56 
 
 
389 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.64 
 
 
528 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  38.08 
 
 
498 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  37.46 
 
 
553 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  35.42 
 
 
543 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  36.84 
 
 
499 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  38.03 
 
 
498 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  38.38 
 
 
498 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  38.38 
 
 
498 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  38.03 
 
 
498 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  38.38 
 
 
498 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  37.01 
 
 
553 aa  179  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  37.94 
 
 
498 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  37.81 
 
 
506 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  37.94 
 
 
498 aa  179  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  37.94 
 
 
498 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.94 
 
 
498 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  37.94 
 
 
498 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  37.94 
 
 
498 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  37.94 
 
 
498 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  38.03 
 
 
498 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  34.04 
 
 
560 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.32 
 
 
526 aa  170  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  32.09 
 
 
530 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  38.91 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.65 
 
 
382 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  47.13 
 
 
390 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50 
 
 
477 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.98 
 
 
387 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.96 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  33.33 
 
 
376 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  33.33 
 
 
368 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  35.14 
 
 
368 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  32.42 
 
 
368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.96 
 
 
383 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  34.67 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  37.5 
 
 
379 aa  113  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  28.32 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  28.4 
 
 
322 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  28.92 
 
 
331 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  26.51 
 
 
318 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.25 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  29.14 
 
 
318 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.37 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  26.82 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  28.98 
 
 
322 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  31.12 
 
 
331 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  26.64 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  28.65 
 
 
321 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.37 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  29.67 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.23 
 
 
337 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  26.96 
 
 
318 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  29.38 
 
 
371 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.16 
 
 
346 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  26.19 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  27.93 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.46 
 
 
332 aa  53.9  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  31.86 
 
 
309 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.75 
 
 
323 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  29.59 
 
 
390 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  29.59 
 
 
390 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  29.59 
 
 
390 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  25.55 
 
 
323 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  30.69 
 
 
370 aa  53.5  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0879  ATPase  27.59 
 
 
334 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.714074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  32.58 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  28.65 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.03 
 
 
315 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.49 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  28.86 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  28.14 
 
 
318 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  26.63 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  25.27 
 
 
332 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.67 
 
 
330 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.75 
 
 
332 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  29.11 
 
 
324 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  31.41 
 
 
309 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  31.41 
 
 
309 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  31.41 
 
 
309 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>