More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0819 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  313  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  56.58 
 
 
154 aa  178  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  55.92 
 
 
150 aa  176  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  50.98 
 
 
153 aa  174  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  55.92 
 
 
150 aa  174  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  55.92 
 
 
150 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  55.92 
 
 
150 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  54.61 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  54.61 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  54.61 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  54.61 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  54.61 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  54.61 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  53.95 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  53.95 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  54.9 
 
 
152 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  53.95 
 
 
150 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  53.95 
 
 
150 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  53.95 
 
 
150 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  53.29 
 
 
154 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  53.29 
 
 
154 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  167  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  53.59 
 
 
165 aa  166  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  53.29 
 
 
150 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  53.95 
 
 
191 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  54.93 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  49.34 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  49.34 
 
 
151 aa  161  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  50.66 
 
 
151 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  48.68 
 
 
161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  50.66 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  49.34 
 
 
151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  53.52 
 
 
140 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  46.71 
 
 
151 aa  157  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  48.03 
 
 
151 aa  156  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  46.05 
 
 
151 aa  155  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  47.37 
 
 
151 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  47.37 
 
 
151 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  54.23 
 
 
140 aa  156  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  47.37 
 
 
151 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  47.37 
 
 
151 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  47.33 
 
 
151 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  48.03 
 
 
151 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  48.03 
 
 
151 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  46.71 
 
 
151 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  46.71 
 
 
151 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  47.37 
 
 
165 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  51.97 
 
 
151 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  46.71 
 
 
151 aa  154  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  47.06 
 
 
152 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  47.06 
 
 
152 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  52.05 
 
 
153 aa  151  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  45.39 
 
 
172 aa  150  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  48.37 
 
 
153 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  50.68 
 
 
169 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  50.68 
 
 
169 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  52.03 
 
 
173 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  49.02 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  45.75 
 
 
153 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  48.65 
 
 
169 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  47.71 
 
 
152 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  48.65 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  48.65 
 
 
158 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  49.32 
 
 
145 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  44.52 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  43.54 
 
 
152 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  43.54 
 
 
152 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  44.52 
 
 
153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  44.52 
 
 
153 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  44.67 
 
 
196 aa  123  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  42.47 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  42.28 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  43.75 
 
 
154 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  39.35 
 
 
166 aa  114  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  41.43 
 
 
203 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  41.22 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  46.15 
 
 
206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  42.31 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  39.19 
 
 
196 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  40.13 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  39.73 
 
 
156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  39.85 
 
 
204 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  41.48 
 
 
173 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  38.56 
 
 
153 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  39.86 
 
 
159 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  42.65 
 
 
172 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  38.67 
 
 
150 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  41.33 
 
 
215 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  42.65 
 
 
176 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  41.33 
 
 
199 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  39.22 
 
 
161 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  38.31 
 
 
166 aa  103  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2516  hypothetical protein  33.69 
 
 
226 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  38.3 
 
 
204 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  39.62 
 
 
162 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  35.95 
 
 
160 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  37.59 
 
 
204 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  35.5 
 
 
209 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>