More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0235 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  100 
 
 		 365 aa  745    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  50.56 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  52.34 
 
 		 391 aa  345  5e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  50.84 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 		 376 aa  338  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  47.67 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  45.94 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  46.61 
 
 		 362 aa  315  6e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  47.32 
 
 		 372 aa  315  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  46.74 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  47.86 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  50.47 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  45.23 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  47.43 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  46.72 
 
 		 360 aa  295  9e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  48.99 
 
 		 353 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  44.83 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  46.29 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  48.08 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  43.87 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  44.54 
 
 		 369 aa  286  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  43.64 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  44.54 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  42.54 
 
 		 355 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  45.92 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  43.71 
 
 		 363 aa  272  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  41.99 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  41.99 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  41.99 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  41.64 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  40 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  39.89 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  40.71 
 
 		 360 aa  245  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  44.41 
 
 		 367 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  43.35 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  38.59 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  42.05 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.79 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 374 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4386  aminotransferase class I and II  37.54 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.933282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.62 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  35.62 
 
 		 353 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  35.62 
 
 		 353 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  35.62 
 
 		 353 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 		 370 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  33.81 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  32.86 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  35.41 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  35.9 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  37.27 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  35.18 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  34.31 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1355  aminotransferase, class I and II  38.1 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  34.03 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.45 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  36.04 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  32.45 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0726  histidinol phosphate aminotransferase  39.71 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  36.04 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.45 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.45 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.45 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 		 370 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  34.53 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  34.86 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  34.53 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  35.13 
 
 		 369 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  34.95 
 
 		 360 aa  175  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  31.75 
 
 		 370 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  32.13 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  34.86 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  35.21 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  34.19 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  35.41 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>