28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2892 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2892  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1707  hypothetical protein  61.61 
 
 		 209 aa  274  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56153e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2512  hypothetical protein  65.1 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00315625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1979  hypothetical protein  50.96 
 
 		 243 aa  234  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1169  hypothetical protein  53.11 
 
 		 212 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1876  hypothetical protein  39.53 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.884343  normal  0.0360481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3858  hypothetical protein  35.47 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1613  hypothetical protein  37.07 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1611  hypothetical protein  32.47 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105603  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3223  hypothetical protein  29.61 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1578  hypothetical protein  32.71 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2738  hypothetical protein  31.72 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3411  hypothetical protein  30.81 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260975 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0551  hypothetical protein  32.72 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.24318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6359  hypothetical protein  31.84 
 
 		 256 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3121  hypothetical protein  27.67 
 
 		 263 aa  97.8  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110248  normal  0.0572682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0022  hypothetical protein  29.28 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1706  hypothetical protein  27.8 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5933  hypothetical protein  30.61 
 
 		 247 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3161  hypothetical protein  27.69 
 
 		 306 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3009  hypothetical protein  27.84 
 
 		 270 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0748  hypothetical protein  30.1 
 
 		 313 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0021519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1518  hypothetical protein  26.02 
 
 		 282 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00888613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6358  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5554  hypothetical protein  27.92 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4215  hypothetical protein  27.82 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>