More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0840 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  66.52 
 
 
468 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  100 
 
 
469 aa  945    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  69.51 
 
 
469 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  65.1 
 
 
468 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  65.31 
 
 
468 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  39.53 
 
 
546 aa  351  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  39.53 
 
 
546 aa  352  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  39.31 
 
 
546 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  42.46 
 
 
548 aa  339  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  38.81 
 
 
546 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  41.36 
 
 
550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  41.03 
 
 
767 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  40.52 
 
 
767 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  40.13 
 
 
479 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  39.87 
 
 
467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  40.73 
 
 
745 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  39.24 
 
 
503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  39.53 
 
 
479 aa  309  8e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  40.34 
 
 
475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  39.79 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  37.88 
 
 
448 aa  305  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  39.57 
 
 
547 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  39.02 
 
 
479 aa  302  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.65 
 
 
484 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  37.12 
 
 
453 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 
484 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
484 aa  299  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  38.78 
 
 
552 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  39.74 
 
 
481 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  40.47 
 
 
562 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  39.22 
 
 
464 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  38.74 
 
 
468 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  41.35 
 
 
478 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  39.2 
 
 
480 aa  290  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  37.24 
 
 
551 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  39.78 
 
 
457 aa  289  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  38.74 
 
 
468 aa  289  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  38.45 
 
 
560 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  37.79 
 
 
550 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  36.36 
 
 
449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  38.22 
 
 
561 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  38.22 
 
 
561 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  38.22 
 
 
561 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  38.22 
 
 
561 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  39.23 
 
 
562 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  38.14 
 
 
561 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  38 
 
 
561 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  38 
 
 
561 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  38.24 
 
 
482 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  38.94 
 
 
561 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  38.46 
 
 
562 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.28 
 
 
481 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  37.11 
 
 
565 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.61 
 
 
462 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  37.67 
 
 
541 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  38.17 
 
 
561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  38.63 
 
 
557 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  39.38 
 
 
477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.81 
 
 
464 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  37.71 
 
 
564 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  37.71 
 
 
564 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  36.1 
 
 
484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  37.45 
 
 
561 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  37.45 
 
 
561 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.37 
 
 
462 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.12 
 
 
462 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.72 
 
 
470 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.99 
 
 
473 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  37.32 
 
 
476 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 
462 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 
462 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  32.95 
 
 
464 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
492 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  34.91 
 
 
485 aa  261  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  39.12 
 
 
474 aa  260  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.72 
 
 
459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  38.99 
 
 
474 aa  259  7e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.01 
 
 
462 aa  259  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.44 
 
 
491 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.49 
 
 
472 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.35 
 
 
470 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  36.91 
 
 
467 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  37.27 
 
 
476 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  37.27 
 
 
476 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  37.27 
 
 
476 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  32.49 
 
 
464 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  36.67 
 
 
458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  36.58 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.43 
 
 
474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 
469 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.07 
 
 
472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.06 
 
 
464 aa  253  8.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 
470 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 
470 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 
470 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.99 
 
 
467 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 
467 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.35 
 
 
463 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.71 
 
 
463 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 
470 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>