56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3312 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  73.53 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  42.22 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  41.48 
 
 		 153 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  41.48 
 
 		 153 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  41.48 
 
 		 153 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  40.74 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  43.64 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  43.64 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  43.64 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  35.11 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  35.11 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.86 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  37.86 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  37.86 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  35.59 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  36.11 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  37.07 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  38.53 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  33.59 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.19 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.55 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.97 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  30.97 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  30.91 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  30.97 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  31.82 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  34.26 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  30.91 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  30.4 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.05 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.53 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  28.04 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  32.38 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.28 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  31.43 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  34.09 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  33.94 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  33.94 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0020  hypothetical protein  26.15 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  33.94 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  37.04 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  32.1 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  22.88 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  24.58 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  27 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  24.58 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  33.9 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  22.95 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.05 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  29.89 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  28.06 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2893  hypothetical protein  30.21 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>