More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0183 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  100 
 
 		 171 aa  346  8e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  80.12 
 
 		 171 aa  287  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  78.95 
 
 		 171 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  74.27 
 
 		 169 aa  261  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  74.51 
 
 		 167 aa  244  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  73.86 
 
 		 167 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  65.66 
 
 		 171 aa  229  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  64.33 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  67.09 
 
 		 172 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  66.25 
 
 		 171 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  63.4 
 
 		 166 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  63.92 
 
 		 170 aa  210  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  62.09 
 
 		 166 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  58.64 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  58.64 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  58.64 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  58.02 
 
 		 166 aa  200  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  58.17 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  58.17 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  58.17 
 
 		 166 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  58.17 
 
 		 166 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  58.17 
 
 		 166 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  58.17 
 
 		 166 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  58.17 
 
 		 166 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  54.17 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  50.3 
 
 		 232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  56.21 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  48.54 
 
 		 171 aa  180  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  53.99 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  53.99 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  50.92 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  53.59 
 
 		 165 aa  174  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  48.47 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  49.39 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  54.43 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  53.8 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  50.63 
 
 		 171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  47.85 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  44.51 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  45.56 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.08 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.08 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  47.24 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  48.08 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  48.08 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  51.83 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.44 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  52.44 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  47.44 
 
 		 197 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  47.44 
 
 		 197 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  47.65 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.56 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.79 
 
 		 197 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  42.94 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  48.17 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  49.39 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  48.77 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  46.67 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.77 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  47.53 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  48.72 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  44.51 
 
 		 170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  49.39 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  48.48 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.18 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  47.88 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  47.88 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  48.17 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  47.56 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  45.12 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.95 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  46.39 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.53 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  45.78 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  45.73 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  45.73 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  45.45 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  45.45 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  47.56 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  45.45 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  45.45 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  45.45 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  45.45 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  45.45 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  45.73 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.27 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.56 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  45.12 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  45.12 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.56 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  45.12 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0554  Redoxin domain protein  40.8 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.95 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  45.12 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  45.12 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  44.85 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  45.12 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>