More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1357 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  73.83 
 
 		 108 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  70.09 
 
 		 108 aa  161  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  65.42 
 
 		 108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  66.36 
 
 		 109 aa  147  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  61.68 
 
 		 108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  61.68 
 
 		 108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  59.26 
 
 		 109 aa  121  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  53.21 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  48.6 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  50.51 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  50.51 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 104 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  46.23 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  44.95 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  49.54 
 
 		 110 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 		 110 aa  92.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  47.96 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4925  ribosomal protein L24  48.91 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0021231  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  46.74 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  41.58 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  45.65 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  44.57 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  43.48 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  47.92 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0409  ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  41.3 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  41.3 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1407  ribosomal protein L24  40.82 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  49.38 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  58.57 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  48.91 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  44.94 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  50.54 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  50.54 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  38.61 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  45 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0488  ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  44.79 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>