More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0878 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
107 aa  216  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  57.94 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  57.01 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 
106 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 
104 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  54.21 
 
 
108 aa  121  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 
104 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  50.47 
 
 
109 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  57.55 
 
 
116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 
112 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  54.29 
 
 
107 aa  116  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  52.94 
 
 
104 aa  115  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  57.01 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  55 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
106 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 
110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  52.43 
 
 
106 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 
110 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 
103 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  47.06 
 
 
103 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
108 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  49.02 
 
 
103 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 
103 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  53.7 
 
 
113 aa  105  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  49.02 
 
 
105 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
108 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
107 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
108 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
108 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  43.81 
 
 
109 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
106 aa  100  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
106 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
111 aa  98.6  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  49 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  48 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  48 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  50.45 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  46.08 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
115 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
109 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  44 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  45.71 
 
 
106 aa  92  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  44.9 
 
 
105 aa  92  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  46.85 
 
 
114 aa  92  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  48.11 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  45 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  44 
 
 
105 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  42 
 
 
105 aa  90.9  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  41.9 
 
 
108 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 
106 aa  90.5  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 
106 aa  90.5  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  47 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  44 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 
115 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
105 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  44.76 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 
113 aa  88.2  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  44 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 
105 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>