More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2765 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
358 aa  705    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  64.25 
 
 
357 aa  455  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  60.06 
 
 
353 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  58.38 
 
 
353 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  59.94 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  59.94 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  59.94 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  55.62 
 
 
348 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  56.58 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  50 
 
 
351 aa  344  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  46.46 
 
 
347 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  45.08 
 
 
357 aa  295  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  47.62 
 
 
348 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  45.94 
 
 
355 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  49.86 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  45.94 
 
 
349 aa  282  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  45.89 
 
 
346 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  45.43 
 
 
346 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  42.06 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  44.05 
 
 
365 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  41.27 
 
 
355 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  47.49 
 
 
347 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  42.06 
 
 
356 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  44.44 
 
 
366 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  42.9 
 
 
346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  41.94 
 
 
376 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  39.77 
 
 
346 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  38.92 
 
 
346 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  42.9 
 
 
344 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  38.84 
 
 
352 aa  225  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  40 
 
 
353 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  38.98 
 
 
354 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  39.27 
 
 
354 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  38.15 
 
 
335 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  36.86 
 
 
337 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  37.84 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 
358 aa  186  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.91 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  38.27 
 
 
474 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  36.76 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  37.54 
 
 
444 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  36.18 
 
 
451 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  35.59 
 
 
486 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  31.3 
 
 
446 aa  178  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  35.31 
 
 
438 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  37.39 
 
 
350 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.83 
 
 
442 aa  177  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 
336 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  34.19 
 
 
450 aa  175  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  34.82 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  35.36 
 
 
455 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
490 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  33.62 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  30.2 
 
 
428 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  35.2 
 
 
471 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  35.2 
 
 
471 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  35.2 
 
 
470 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  36.54 
 
 
574 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  34.83 
 
 
453 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  31.36 
 
 
441 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.2 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  35.67 
 
 
455 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  34.73 
 
 
452 aa  165  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  35.59 
 
 
503 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  34.58 
 
 
452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  28.61 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.52 
 
 
446 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  29.62 
 
 
456 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  30.48 
 
 
428 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  29.53 
 
 
444 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
333 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  35.09 
 
 
450 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  29.67 
 
 
449 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  32.95 
 
 
437 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  29.67 
 
 
449 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  36.86 
 
 
332 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  34.29 
 
 
452 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  36.86 
 
 
332 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  30.48 
 
 
428 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  36.86 
 
 
332 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  34.9 
 
 
433 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  33.52 
 
 
443 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  34.12 
 
 
337 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  36.23 
 
 
439 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  32.68 
 
 
520 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  34.81 
 
 
451 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  35.48 
 
 
451 aa  159  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  28.98 
 
 
449 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  31.29 
 
 
430 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  34.41 
 
 
443 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  33.62 
 
 
334 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  32.74 
 
 
469 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
336 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.49 
 
 
446 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  33.24 
 
 
442 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3861  hypothetical protein  36.86 
 
 
332 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  35.65 
 
 
443 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  32.74 
 
 
464 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  25.21 
 
 
451 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>