More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3000 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  78.42 
 
 		 348 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  68.91 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  57.43 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  54.52 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  56.2 
 
 		 346 aa  359  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  55.59 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  55.35 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  52.15 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  58.2 
 
 		 347 aa  325  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  51.03 
 
 		 356 aa  325  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  55.38 
 
 		 346 aa  322  8e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  49.15 
 
 		 356 aa  316  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  52.57 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  51.49 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  51.19 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  45.94 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  49.56 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  48.39 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  50.72 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  47.11 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  49.54 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  46.88 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  47.76 
 
 		 351 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  47.76 
 
 		 351 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  46.31 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  47.76 
 
 		 351 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  48.77 
 
 		 365 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  44.64 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  47.6 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  40.88 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  40.59 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  41.92 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  33.64 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  43.82 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  33.64 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  31.45 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  34.97 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  38.69 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  30.7 
 
 		 435 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  30.7 
 
 		 435 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  30.7 
 
 		 435 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  30.7 
 
 		 435 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  30.42 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  30.42 
 
 		 435 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  30.42 
 
 		 435 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  39.15 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  30.79 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  30.79 
 
 		 449 aa  192  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  30.79 
 
 		 435 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  32.34 
 
 		 444 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30.61 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  35.76 
 
 		 430 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  33.72 
 
 		 490 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  33.82 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  35.8 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  31.8 
 
 		 456 aa  187  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  38.04 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  31.87 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  39.32 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  31.45 
 
 		 428 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  30.75 
 
 		 443 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  30.03 
 
 		 451 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  30.03 
 
 		 451 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  31.16 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  30.03 
 
 		 451 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  34.87 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  39.45 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  30.15 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  30.03 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.1 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  31.29 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  36.81 
 
 		 336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  30.15 
 
 		 443 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.4 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  30.15 
 
 		 443 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.4 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  32.62 
 
 		 439 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  35.12 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  32.95 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.24 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  38.82 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  34.33 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  36.9 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.97 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  29.85 
 
 		 444 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  31.1 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  38.53 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  32.37 
 
 		 432 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  32.37 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  32.66 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  32.37 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  38.51 
 
 		 350 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.81 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  34.53 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  37.65 
 
 		 441 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>