More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5345 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
348 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  59.65 
 
 
351 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  55.62 
 
 
358 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  52.99 
 
 
353 aa  345  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  52.14 
 
 
353 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  53.8 
 
 
357 aa  342  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  53.57 
 
 
351 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  53.57 
 
 
351 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  53.57 
 
 
351 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  50.31 
 
 
365 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  48.82 
 
 
347 aa  292  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  48.39 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  40.75 
 
 
356 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  42.9 
 
 
356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  46.09 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  44.08 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  47.35 
 
 
349 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  45.9 
 
 
346 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  45.8 
 
 
346 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  49.23 
 
 
348 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  46.69 
 
 
376 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  43.54 
 
 
346 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  44.28 
 
 
346 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  44.41 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  48.3 
 
 
347 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  45.48 
 
 
366 aa  252  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  42.57 
 
 
355 aa  249  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 
352 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  40.34 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  40.58 
 
 
354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  40 
 
 
354 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  36.86 
 
 
335 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  38.64 
 
 
474 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  35.24 
 
 
437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  38.48 
 
 
438 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  36.2 
 
 
457 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  35.09 
 
 
437 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  32.82 
 
 
439 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  34.71 
 
 
443 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  39.12 
 
 
453 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.72 
 
 
446 aa  189  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  37.95 
 
 
337 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  36.7 
 
 
344 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  35.67 
 
 
464 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  37.86 
 
 
444 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
446 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  35.28 
 
 
451 aa  185  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.56 
 
 
442 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  31.27 
 
 
446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  37.79 
 
 
574 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 
490 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  35.94 
 
 
334 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  39.26 
 
 
450 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  33.33 
 
 
446 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  30.46 
 
 
449 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  30.46 
 
 
449 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  34.56 
 
 
450 aa  179  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 
449 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  33.84 
 
 
433 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
455 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  37.65 
 
 
452 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  37.35 
 
 
337 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  30.77 
 
 
446 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  37.96 
 
 
503 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  36.39 
 
 
452 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  28.78 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.29 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  28.83 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28.78 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  28.78 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  28.49 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28.78 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28.78 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  30.56 
 
 
448 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  29.59 
 
 
444 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  37.28 
 
 
332 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  28.7 
 
 
440 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  30.99 
 
 
432 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  30.99 
 
 
432 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  35.14 
 
 
336 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 
361 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  30.99 
 
 
432 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 
361 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.18 
 
 
425 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  28.49 
 
 
435 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  35.95 
 
 
336 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  33.72 
 
 
431 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  28.49 
 
 
435 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2502  hypothetical protein  34.55 
 
 
437 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  35.26 
 
 
460 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  28.99 
 
 
442 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  34.52 
 
 
471 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  37.54 
 
 
332 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  34.12 
 
 
453 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  34.52 
 
 
471 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  37.54 
 
 
332 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  34.52 
 
 
470 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  37.54 
 
 
332 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>