More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1953 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  680    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  77.39 
 
 
355 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  65.79 
 
 
347 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  56.94 
 
 
346 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  56.5 
 
 
357 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  57.73 
 
 
349 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  54.74 
 
 
346 aa  347  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  53.99 
 
 
365 aa  347  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  51.41 
 
 
355 aa  343  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  52.49 
 
 
356 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  55.26 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  58.72 
 
 
347 aa  339  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  51.32 
 
 
356 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  52.77 
 
 
366 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  47.62 
 
 
358 aa  319  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  49.56 
 
 
351 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  50.74 
 
 
346 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  50.45 
 
 
346 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  47.47 
 
 
357 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  48.68 
 
 
348 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  48.16 
 
 
365 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  50.76 
 
 
352 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  49.28 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  44.32 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  45.07 
 
 
351 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  45.07 
 
 
351 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  43.79 
 
 
353 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  45.07 
 
 
351 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  43.58 
 
 
335 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  42.43 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  42.99 
 
 
344 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  41.28 
 
 
354 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  40.41 
 
 
354 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  39.55 
 
 
353 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  40.48 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  39.33 
 
 
333 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  34.97 
 
 
449 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  34.97 
 
 
449 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  33.92 
 
 
448 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  32.75 
 
 
449 aa  198  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  32.94 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  36.02 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  40.55 
 
 
337 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  33.43 
 
 
440 aa  195  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
446 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  32.66 
 
 
442 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  32.38 
 
 
442 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  38.01 
 
 
358 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  32.38 
 
 
442 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  32.07 
 
 
444 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  30.58 
 
 
435 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  32.66 
 
 
442 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  32.38 
 
 
442 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  35.76 
 
 
432 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.38 
 
 
442 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.38 
 
 
442 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  35.76 
 
 
432 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  29.62 
 
 
435 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  29.62 
 
 
435 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  29.62 
 
 
435 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  29.33 
 
 
435 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  29.62 
 
 
435 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
442 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  29.33 
 
 
435 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  34.48 
 
 
446 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  35.17 
 
 
432 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.17 
 
 
432 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 
435 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  35.17 
 
 
432 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  35.16 
 
 
432 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 
435 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  34.85 
 
 
430 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  32.27 
 
 
437 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  35.17 
 
 
432 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 
435 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.52 
 
 
440 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  29.97 
 
 
435 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  30.03 
 
 
451 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  38.02 
 
 
350 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  32.94 
 
 
428 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  35.03 
 
 
437 aa  185  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.91 
 
 
425 aa  185  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  34.36 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  32.94 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  31.7 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  35.42 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  32.83 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  35.82 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  36.2 
 
 
334 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  32.94 
 
 
441 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  38.94 
 
 
334 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  29.15 
 
 
451 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  29.15 
 
 
451 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  29.15 
 
 
451 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  29.15 
 
 
451 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  29.85 
 
 
443 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  33.72 
 
 
490 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  30.15 
 
 
444 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>