More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0413 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
333 aa  651    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  65.87 
 
 
342 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  68.47 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  65.07 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  67.27 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  67.27 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  67.27 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3861  hypothetical protein  67.57 
 
 
332 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2950  protein of unknown function DUF21  61.63 
 
 
341 aa  361  9e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  57.88 
 
 
340 aa  360  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  62.76 
 
 
340 aa  359  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  57.96 
 
 
336 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  57.5 
 
 
336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  57.93 
 
 
350 aa  335  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0319  protein of unknown function DUF21  50.29 
 
 
342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000713194  normal  0.0140808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3114  hypothetical protein  47.89 
 
 
345 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  48.05 
 
 
354 aa  255  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  47.75 
 
 
354 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  46.73 
 
 
344 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  45.95 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  40.87 
 
 
353 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  41.07 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  43.65 
 
 
337 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  39.06 
 
 
348 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  37.57 
 
 
353 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  42.59 
 
 
334 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  37.57 
 
 
353 aa  188  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  40.37 
 
 
355 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  37.9 
 
 
357 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  38.3 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  36.89 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  35.99 
 
 
351 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  38.11 
 
 
347 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  37 
 
 
351 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  37 
 
 
351 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  37 
 
 
351 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  37.62 
 
 
366 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  35.42 
 
 
349 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  37.93 
 
 
346 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
346 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  34.8 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  33.63 
 
 
356 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
358 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  34.86 
 
 
346 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  35.31 
 
 
346 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  36.5 
 
 
365 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  36.2 
 
 
346 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  37.27 
 
 
352 aa  169  9e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  34.71 
 
 
348 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.74 
 
 
437 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  27.71 
 
 
451 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  37.85 
 
 
347 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  29.67 
 
 
444 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  34.33 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  34.83 
 
 
365 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  35.01 
 
 
463 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  26.97 
 
 
443 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  26.97 
 
 
443 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  33.95 
 
 
356 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.74 
 
 
446 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  33.13 
 
 
486 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  35.31 
 
 
376 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  34.41 
 
 
443 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
432 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  29.43 
 
 
441 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  29.67 
 
 
442 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  29.67 
 
 
442 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.83 
 
 
432 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  29.67 
 
 
442 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  28.49 
 
 
440 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  28.53 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  29.38 
 
 
442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  29.38 
 
 
442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  28.53 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  28.83 
 
 
437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  28.83 
 
 
432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  28.53 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  28.53 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  28.53 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  30.93 
 
 
446 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  32.83 
 
 
440 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  28.78 
 
 
442 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  28.78 
 
 
442 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.61 
 
 
425 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  28.78 
 
 
440 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  29.13 
 
 
432 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  30.84 
 
 
446 aa  146  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  28.49 
 
 
442 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  28.27 
 
 
435 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  31.61 
 
 
443 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  33.74 
 
 
520 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  26.67 
 
 
443 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  26.36 
 
 
435 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  26.36 
 
 
435 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  26.36 
 
 
435 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  28.4 
 
 
448 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  26.67 
 
 
435 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  27.27 
 
 
444 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  26.36 
 
 
435 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>