More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0319 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0319  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
342 aa  679    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000713194  normal  0.0140808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3114  hypothetical protein  58.24 
 
 
345 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  52.8 
 
 
342 aa  325  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  51.93 
 
 
336 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  48.54 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  50.29 
 
 
333 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2950  protein of unknown function DUF21  50.15 
 
 
341 aa  288  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  50.3 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  50.59 
 
 
340 aa  279  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3861  hypothetical protein  49.85 
 
 
332 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  47.79 
 
 
332 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  47.79 
 
 
332 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  47.79 
 
 
332 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  46.88 
 
 
332 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  42.43 
 
 
340 aa  249  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  43.81 
 
 
336 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  38.3 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  39.51 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  36.36 
 
 
353 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  38.53 
 
 
337 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  37.8 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  35.82 
 
 
354 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  34.63 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  33.84 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  32.94 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  30.9 
 
 
355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  35.14 
 
 
351 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  35.14 
 
 
351 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  35.14 
 
 
351 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  32.75 
 
 
349 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  31.71 
 
 
366 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 
346 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  32.87 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  31.98 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  30.31 
 
 
357 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  32.36 
 
 
355 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  32.35 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  30.59 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 
346 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  32.27 
 
 
353 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  31.43 
 
 
358 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  32.27 
 
 
461 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  31.5 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  32.52 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  29.86 
 
 
365 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  27.78 
 
 
446 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  30.18 
 
 
441 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  31.14 
 
 
345 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  35.06 
 
 
348 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  31.5 
 
 
376 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  30.42 
 
 
443 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  30.56 
 
 
346 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  32.42 
 
 
352 aa  122  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  27.84 
 
 
490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  30.15 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  28.53 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  30.42 
 
 
520 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  29.53 
 
 
439 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  27.99 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  28.66 
 
 
437 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  30.29 
 
 
440 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  26.57 
 
 
437 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  26.36 
 
 
446 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  25.71 
 
 
440 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  29.88 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  27.14 
 
 
442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  30.75 
 
 
444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  32.52 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  29.88 
 
 
418 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  29.18 
 
 
431 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  25.43 
 
 
442 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  25.43 
 
 
442 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  25.43 
 
 
442 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0152  hypothetical protein  28.14 
 
 
446 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  30.64 
 
 
455 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  25.43 
 
 
442 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  25.43 
 
 
442 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  28.23 
 
 
463 aa  112  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  25.43 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  25.43 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  27.47 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  25.51 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  26 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  25.36 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  29.61 
 
 
433 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  29.2 
 
 
452 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  25.43 
 
 
442 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  32.13 
 
 
347 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6141  hypothetical protein  29.04 
 
 
446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  28.61 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  25.44 
 
 
428 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70770  hypothetical protein  29.04 
 
 
446 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  32.39 
 
 
365 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  28.53 
 
 
356 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  27.74 
 
 
446 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  30.33 
 
 
443 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  24.57 
 
 
432 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  25.51 
 
 
442 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  24.86 
 
 
361 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  24.86 
 
 
432 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>