More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2961 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
376 aa  733    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  52.49 
 
 
347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  52.89 
 
 
346 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  48.04 
 
 
346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  48.37 
 
 
365 aa  301  9e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  50.55 
 
 
355 aa  299  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  48.43 
 
 
349 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  46.65 
 
 
355 aa  291  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  49.02 
 
 
357 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  45.28 
 
 
356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  49.14 
 
 
348 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  46.38 
 
 
346 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  43.56 
 
 
356 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  46.69 
 
 
348 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  49.71 
 
 
347 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  43.39 
 
 
357 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  44.51 
 
 
366 aa  262  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  43.14 
 
 
346 aa  259  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  47.13 
 
 
365 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  44.03 
 
 
346 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  42.35 
 
 
358 aa  255  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  41.44 
 
 
351 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  44.04 
 
 
353 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  42.9 
 
 
351 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  43.94 
 
 
352 aa  243  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  42.9 
 
 
351 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  42.9 
 
 
351 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  42.66 
 
 
353 aa  242  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  40.87 
 
 
335 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  43.22 
 
 
345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  38.83 
 
 
354 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  39.89 
 
 
354 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  37.54 
 
 
344 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  38.23 
 
 
353 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  36.63 
 
 
358 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  35.24 
 
 
437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  41.06 
 
 
337 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  33.52 
 
 
443 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  30.9 
 
 
439 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  32.86 
 
 
446 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.12 
 
 
446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  31.55 
 
 
446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  34.35 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
438 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  31.44 
 
 
490 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  29.95 
 
 
434 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  33.91 
 
 
503 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  35.03 
 
 
336 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  35.62 
 
 
471 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  35.62 
 
 
471 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  35.62 
 
 
470 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.77 
 
 
442 aa  160  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  30.35 
 
 
440 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  31.2 
 
 
486 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  35.31 
 
 
333 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  32.59 
 
 
443 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  33.61 
 
 
574 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  32.77 
 
 
342 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  36.66 
 
 
340 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  34.57 
 
 
450 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  32.7 
 
 
451 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  34.54 
 
 
455 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  32.77 
 
 
441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  35.16 
 
 
337 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.26 
 
 
438 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  34.6 
 
 
336 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  30.41 
 
 
450 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  28.81 
 
 
444 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  29.66 
 
 
446 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  36.87 
 
 
334 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  34.69 
 
 
474 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  36.07 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  27.65 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  27.65 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
449 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  33.05 
 
 
452 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  31.36 
 
 
461 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  32.85 
 
 
451 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  28.17 
 
 
446 aa  152  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  27.78 
 
 
428 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  36.94 
 
 
332 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  33.43 
 
 
457 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  34.8 
 
 
334 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  33.88 
 
 
451 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  31.59 
 
 
442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  27.84 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  31.59 
 
 
433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  36.45 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  36.45 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  36.45 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  32.77 
 
 
452 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 
452 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  27.76 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0152  hypothetical protein  32.26 
 
 
446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  31.78 
 
 
443 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  26.82 
 
 
451 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  26.82 
 
 
451 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  26.82 
 
 
451 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  26.81 
 
 
435 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  26.81 
 
 
435 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>