More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2719 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  685    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  58.11 
 
 
347 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  57.73 
 
 
348 aa  364  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  57.43 
 
 
355 aa  359  4e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  53.52 
 
 
346 aa  328  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  51.87 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  50.58 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  51.14 
 
 
357 aa  325  7e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  53.96 
 
 
366 aa  322  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  51.37 
 
 
346 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  47.38 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  48.75 
 
 
365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  53.7 
 
 
347 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  47.35 
 
 
346 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  45.35 
 
 
356 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  45.94 
 
 
358 aa  292  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  45.88 
 
 
346 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  45.63 
 
 
357 aa  288  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  47.35 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  48.26 
 
 
376 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  48.26 
 
 
365 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 
351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  44.08 
 
 
351 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  44.08 
 
 
351 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  44.08 
 
 
351 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  43.77 
 
 
353 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  44.06 
 
 
353 aa  262  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  45.71 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  41.49 
 
 
335 aa  245  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  42.04 
 
 
345 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  38.75 
 
 
353 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  37.17 
 
 
354 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  36.1 
 
 
446 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  36.87 
 
 
354 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  39.33 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  35.01 
 
 
446 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  32.72 
 
 
439 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  34.66 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  30.84 
 
 
444 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.53 
 
 
437 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  29.68 
 
 
446 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  30.42 
 
 
428 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  30.12 
 
 
446 aa  186  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  35.54 
 
 
430 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  29.53 
 
 
428 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.09 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  28.87 
 
 
435 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28.87 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  28.87 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  30.25 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28.87 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  30.25 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28.87 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  28.87 
 
 
435 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
435 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
435 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  34.23 
 
 
340 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.5 
 
 
442 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  28.22 
 
 
435 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  29.19 
 
 
449 aa  180  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  29.68 
 
 
448 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  36.01 
 
 
340 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  28.53 
 
 
435 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  34.59 
 
 
431 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  35.12 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  34.02 
 
 
443 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  35.71 
 
 
337 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  35.37 
 
 
433 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  37.05 
 
 
486 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  35.61 
 
 
342 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.53 
 
 
442 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.24 
 
 
442 aa  176  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  32.14 
 
 
438 aa  175  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  35.09 
 
 
437 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2502  hypothetical protein  32.84 
 
 
437 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  33.04 
 
 
446 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  29.53 
 
 
428 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  35.4 
 
 
334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  34.03 
 
 
443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  39.01 
 
 
334 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  28.21 
 
 
445 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  32.72 
 
 
336 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  29.24 
 
 
428 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5479  transporter, putative  35.57 
 
 
446 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  28.73 
 
 
432 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5034  CBS-domain containing protein  35.57 
 
 
446 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  32.87 
 
 
455 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 
361 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  28.73 
 
 
432 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  28.73 
 
 
432 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 
361 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  29.29 
 
 
440 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.18 
 
 
442 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  28.05 
 
 
432 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  28.45 
 
 
432 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  36.12 
 
 
350 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  29.88 
 
 
442 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  29.59 
 
 
442 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.24 
 
 
440 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  29.59 
 
 
442 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>