More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3860 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
350 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  59.76 
 
 
342 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2950  protein of unknown function DUF21  63.64 
 
 
341 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  58.54 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  59.63 
 
 
336 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  59.76 
 
 
332 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  59.76 
 
 
332 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  59.76 
 
 
332 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  58.84 
 
 
340 aa  330  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  57.93 
 
 
333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  58.54 
 
 
332 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3861  hypothetical protein  57.93 
 
 
332 aa  316  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  52.31 
 
 
340 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  50.63 
 
 
336 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3114  hypothetical protein  48.41 
 
 
345 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0319  protein of unknown function DUF21  50.3 
 
 
342 aa  295  7e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000713194  normal  0.0140808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  44.24 
 
 
344 aa  232  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  45.57 
 
 
337 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  42.9 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  42.31 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  42.49 
 
 
353 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  38.2 
 
 
358 aa  200  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  49.04 
 
 
337 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  37.39 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  41.56 
 
 
334 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  37.77 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  36.18 
 
 
357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  38.51 
 
 
355 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  35.48 
 
 
348 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  35.63 
 
 
461 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  36.12 
 
 
349 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  33.92 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.85 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.54 
 
 
437 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  35.67 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  35.2 
 
 
346 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  35.56 
 
 
351 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  35.56 
 
 
351 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  35.56 
 
 
351 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  34.21 
 
 
346 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  32.94 
 
 
353 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  35.12 
 
 
486 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  33.98 
 
 
450 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  35.47 
 
 
345 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  35.77 
 
 
365 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  32.26 
 
 
346 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  34.02 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  34.93 
 
 
574 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  32.72 
 
 
346 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  32.15 
 
 
356 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  31.81 
 
 
356 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  36.88 
 
 
366 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  35.59 
 
 
441 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  33.93 
 
 
431 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  33.24 
 
 
357 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  34.13 
 
 
520 aa  149  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  27.79 
 
 
451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  27.79 
 
 
451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  27.79 
 
 
451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  34.36 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  28.18 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  28.37 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  28.37 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  28.65 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  34.03 
 
 
444 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
361 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
361 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  33.93 
 
 
439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  32.07 
 
 
355 aa  146  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  28.09 
 
 
432 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  27.98 
 
 
443 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  27.9 
 
 
432 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  34.66 
 
 
365 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  27.62 
 
 
432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 
437 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.21 
 
 
425 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  30.15 
 
 
444 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  28.03 
 
 
446 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  27.7 
 
 
443 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  34.51 
 
 
443 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  26.92 
 
 
451 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  26.2 
 
 
428 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  31.78 
 
 
496 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  34.32 
 
 
474 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  30.12 
 
 
443 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  27.42 
 
 
443 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  27.53 
 
 
441 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  32.23 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  33.23 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  28.7 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  31.88 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  29.76 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  33.23 
 
 
503 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  26.87 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  27.47 
 
 
442 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  32.05 
 
 
438 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  27.15 
 
 
444 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  27.47 
 
 
442 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  26.92 
 
 
440 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>