More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1235 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
346 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  62.5 
 
 
346 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  58.17 
 
 
365 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  60.98 
 
 
347 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  54.52 
 
 
356 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  55.29 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  54.23 
 
 
356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  53.27 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  56.76 
 
 
347 aa  350  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  53.22 
 
 
349 aa  344  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  54.85 
 
 
352 aa  338  8e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  55.26 
 
 
348 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  53.04 
 
 
376 aa  322  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  54.25 
 
 
355 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  51.38 
 
 
366 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  48.87 
 
 
357 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  49.72 
 
 
355 aa  308  5.9999999999999995e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  51.08 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  50.31 
 
 
365 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  48.4 
 
 
351 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  45.69 
 
 
357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  44.09 
 
 
348 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  42.78 
 
 
358 aa  262  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  44.51 
 
 
353 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  43.64 
 
 
335 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  44.22 
 
 
353 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  44.31 
 
 
351 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  44.31 
 
 
351 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  44.31 
 
 
351 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  43.07 
 
 
345 aa  232  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  39.94 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  41.57 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  40 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  40.23 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  37.65 
 
 
437 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  38.57 
 
 
353 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.16 
 
 
435 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  31.16 
 
 
435 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  31.16 
 
 
435 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  31.16 
 
 
435 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  31.16 
 
 
435 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  31.16 
 
 
435 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 
449 aa  195  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  37.05 
 
 
446 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  30.86 
 
 
435 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  30.86 
 
 
435 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.86 
 
 
442 aa  193  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
444 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  42.37 
 
 
334 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  33.63 
 
 
446 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  34.9 
 
 
432 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  33.13 
 
 
449 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  33.13 
 
 
449 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  34.9 
 
 
432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  39.14 
 
 
337 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  30.37 
 
 
435 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
448 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  30.98 
 
 
435 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  35.45 
 
 
431 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.29 
 
 
432 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  35 
 
 
432 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  34.38 
 
 
432 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  35 
 
 
361 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  35 
 
 
432 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  35 
 
 
361 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  32.17 
 
 
446 aa  187  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  37.5 
 
 
474 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  34.71 
 
 
432 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  37.65 
 
 
337 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.01 
 
 
425 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  35.47 
 
 
443 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  32.21 
 
 
456 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  30.65 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  36.06 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  32.08 
 
 
451 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  32.42 
 
 
439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  31.96 
 
 
443 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  38.11 
 
 
333 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  30.12 
 
 
428 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  31.67 
 
 
443 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  35.01 
 
 
342 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  35.48 
 
 
440 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  37.46 
 
 
486 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  32.35 
 
 
441 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  36.07 
 
 
444 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
451 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  31.5 
 
 
451 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
451 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4406  hypothetical protein  36.42 
 
 
446 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.13627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  31.09 
 
 
443 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  37.43 
 
 
471 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  37.43 
 
 
471 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  37.43 
 
 
470 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  31.86 
 
 
437 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  31.5 
 
 
451 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.27 
 
 
440 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  31.67 
 
 
443 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  37.43 
 
 
340 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
442 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>