More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1409 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  94.03 
 
 
452 aa  821    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  870    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  65.21 
 
 
468 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  55.3 
 
 
451 aa  428  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  54.02 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  54.22 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  52.03 
 
 
441 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  52.24 
 
 
451 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  49.67 
 
 
520 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  49.55 
 
 
458 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  49.55 
 
 
458 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  49.32 
 
 
458 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  48.23 
 
 
453 aa  359  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  51.24 
 
 
478 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  51.27 
 
 
469 aa  352  7e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  51.29 
 
 
486 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  50.45 
 
 
451 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  48.78 
 
 
459 aa  340  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  47.12 
 
 
455 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  46.49 
 
 
496 aa  335  7e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  46.05 
 
 
456 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  49.2 
 
 
464 aa  323  4e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  46.56 
 
 
450 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  45.61 
 
 
444 aa  305  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  43.55 
 
 
438 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  43.33 
 
 
574 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  40.27 
 
 
460 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  42.86 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3861  protein of unknown function DUF21  47.01 
 
 
460 aa  279  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00340007  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  40.9 
 
 
455 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  42.6 
 
 
503 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  43.23 
 
 
451 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  40.18 
 
 
452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  39.37 
 
 
490 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  40 
 
 
461 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  41.77 
 
 
471 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  41.77 
 
 
471 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  41.77 
 
 
470 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  38.94 
 
 
486 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  41.1 
 
 
442 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  41.67 
 
 
450 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  40.91 
 
 
474 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  39.5 
 
 
451 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  41.3 
 
 
455 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  38.13 
 
 
457 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  38.41 
 
 
451 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  39.15 
 
 
453 aa  239  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  41.31 
 
 
439 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  38.16 
 
 
443 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  40.4 
 
 
452 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  40.87 
 
 
453 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  38.17 
 
 
443 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  38.17 
 
 
445 aa  224  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  39.9 
 
 
438 aa  219  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.12 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.92 
 
 
440 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  31.94 
 
 
442 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 
442 aa  203  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  31.7 
 
 
442 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  31.7 
 
 
442 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.09 
 
 
437 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  33.17 
 
 
432 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  32.92 
 
 
432 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  29.1 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  31.7 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  32.17 
 
 
437 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.42 
 
 
440 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.59 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.54 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  31.2 
 
 
442 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  31.2 
 
 
442 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.96 
 
 
442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  31.66 
 
 
435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.67 
 
 
428 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.27 
 
 
434 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  32.44 
 
 
432 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  32.44 
 
 
432 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  32.44 
 
 
432 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  31.17 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.43 
 
 
432 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  32.43 
 
 
432 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  32.58 
 
 
456 aa  194  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  31.04 
 
 
435 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  31.04 
 
 
435 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  31.04 
 
 
435 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  31.04 
 
 
435 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  32.5 
 
 
428 aa  192  7e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.04 
 
 
435 aa  193  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.42 
 
 
425 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  35.18 
 
 
443 aa  192  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.61 
 
 
442 aa  192  8e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  32.11 
 
 
431 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  30.79 
 
 
435 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  30.81 
 
 
441 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  30.79 
 
 
435 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  30.81 
 
 
430 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  32.11 
 
 
438 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 
443 aa  189  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  31.32 
 
 
435 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  31.32 
 
 
435 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>