More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0508 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
451 aa  858    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  52.93 
 
 
574 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  53.04 
 
 
503 aa  395  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  53.79 
 
 
450 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  50.94 
 
 
444 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  53.29 
 
 
453 aa  345  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  48.29 
 
 
486 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  47.18 
 
 
453 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  47.06 
 
 
452 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  44.19 
 
 
438 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  47.8 
 
 
452 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  47.17 
 
 
443 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  46.47 
 
 
443 aa  322  8e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  48.52 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  48.52 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  48.52 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  45.49 
 
 
460 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  46.23 
 
 
455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  46.7 
 
 
445 aa  319  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  46.7 
 
 
450 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  48.24 
 
 
439 aa  315  9e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  44.11 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  44.14 
 
 
490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  43.86 
 
 
451 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  47.78 
 
 
451 aa  309  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  45.69 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  46.3 
 
 
474 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  43.93 
 
 
442 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  45.88 
 
 
438 aa  285  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  41.91 
 
 
455 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  42.4 
 
 
520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  40.36 
 
 
452 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  40.09 
 
 
452 aa  266  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  39.45 
 
 
451 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  39.69 
 
 
451 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  37.41 
 
 
458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  37.41 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  37.41 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  39.31 
 
 
441 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  34.13 
 
 
446 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  38.79 
 
 
460 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  38.71 
 
 
462 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  40.3 
 
 
486 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  40.1 
 
 
464 aa  223  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  36 
 
 
431 aa  222  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  34.3 
 
 
446 aa  220  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.63 
 
 
446 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  34.55 
 
 
433 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  39.01 
 
 
468 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  36.57 
 
 
453 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  38.88 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.84 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.84 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  39.29 
 
 
451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  30.86 
 
 
435 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.4 
 
 
442 aa  212  9e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.61 
 
 
442 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  29.58 
 
 
435 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.37 
 
 
442 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
442 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.37 
 
 
442 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.37 
 
 
442 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  29.18 
 
 
446 aa  210  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.65 
 
 
437 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  29.41 
 
 
435 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  37.35 
 
 
459 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  29.11 
 
 
435 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  29.11 
 
 
435 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  29.11 
 
 
435 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  29.11 
 
 
435 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  34.48 
 
 
456 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  35.34 
 
 
469 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  28.95 
 
 
435 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.84 
 
 
440 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 
435 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 
435 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
435 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  29.65 
 
 
434 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  33.87 
 
 
443 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  29.14 
 
 
448 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 
443 aa  203  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  29.41 
 
 
438 aa  202  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  32.86 
 
 
434 aa  202  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  28.79 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.93 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  34.6 
 
 
496 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  28.06 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 
432 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  31.22 
 
 
432 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  31.29 
 
 
439 aa  199  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  27.76 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  29.74 
 
 
477 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  29.93 
 
 
444 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  30.99 
 
 
432 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 
449 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  30.91 
 
 
432 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.28 
 
 
432 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3861  protein of unknown function DUF21  38.15 
 
 
460 aa  194  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00340007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>