More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0445 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
451 aa  883    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  76.51 
 
 
469 aa  648    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  67.57 
 
 
478 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  62.01 
 
 
496 aa  531  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  65.13 
 
 
464 aa  519  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  59.56 
 
 
458 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  59.34 
 
 
458 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  59.34 
 
 
458 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  60.49 
 
 
453 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  61.63 
 
 
455 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  59.2 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  58.88 
 
 
462 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  60.44 
 
 
459 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  54.21 
 
 
456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  59.87 
 
 
450 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3861  protein of unknown function DUF21  58.72 
 
 
460 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00340007  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  50.45 
 
 
452 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  49.78 
 
 
452 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  48.75 
 
 
520 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  44.44 
 
 
451 aa  316  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  43.94 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  48.36 
 
 
486 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  43.74 
 
 
451 aa  301  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  45.09 
 
 
468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  39.9 
 
 
450 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  37.45 
 
 
444 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  39.62 
 
 
471 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  39.62 
 
 
471 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  39.62 
 
 
470 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  38.44 
 
 
452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  39.44 
 
 
503 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  39.23 
 
 
451 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
455 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  38.46 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  42.46 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  37.31 
 
 
574 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  37.47 
 
 
438 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  37.09 
 
 
460 aa  229  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  37.16 
 
 
461 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  35.64 
 
 
486 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  39.29 
 
 
451 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  39.16 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  38.86 
 
 
455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  37.07 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  35.63 
 
 
490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  36.58 
 
 
443 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  34.4 
 
 
446 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  37.5 
 
 
453 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  38.85 
 
 
451 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  39.23 
 
 
438 aa  200  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  37.68 
 
 
439 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  36.43 
 
 
443 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  31.76 
 
 
446 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.54 
 
 
437 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 
433 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.12 
 
 
428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.63 
 
 
440 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  32.33 
 
 
438 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 
442 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  29.14 
 
 
442 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  29.14 
 
 
442 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  37.56 
 
 
453 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  29.48 
 
 
435 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  29.14 
 
 
442 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 
442 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  29.14 
 
 
442 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  28.9 
 
 
442 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  30.32 
 
 
440 aa  187  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  28.9 
 
 
442 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  30.48 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  30.56 
 
 
432 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  33.79 
 
 
442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  34.95 
 
 
445 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  30.48 
 
 
432 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  30.63 
 
 
430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  29.97 
 
 
432 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  32.62 
 
 
443 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  29.97 
 
 
432 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.75 
 
 
432 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  33.08 
 
 
441 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  29.97 
 
 
432 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  33.33 
 
 
442 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  29.28 
 
 
441 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.51 
 
 
425 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  27.78 
 
 
435 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  34.7 
 
 
555 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  27.27 
 
 
435 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  27.27 
 
 
435 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  27.27 
 
 
435 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  27.27 
 
 
435 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  28.24 
 
 
435 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  27.53 
 
 
435 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  31.41 
 
 
450 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  32.91 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  27.02 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  27.02 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  30.38 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  28.41 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  27.43 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  27.94 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>