More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3540 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  894    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  894    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  81.42 
 
 
453 aa  718    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  99.78 
 
 
458 aa  891    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  82.06 
 
 
455 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  69.89 
 
 
450 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  71.43 
 
 
459 aa  551  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  62.56 
 
 
469 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  61.28 
 
 
464 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  61.63 
 
 
478 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  58.12 
 
 
496 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  59.34 
 
 
451 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  59.91 
 
 
462 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  56.73 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  52.19 
 
 
456 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3861  protein of unknown function DUF21  56.68 
 
 
460 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00340007  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  49.21 
 
 
520 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  49.55 
 
 
452 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  48.02 
 
 
452 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  51.29 
 
 
486 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  46.64 
 
 
441 aa  332  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  44.89 
 
 
451 aa  319  5e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  46.14 
 
 
451 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  47.14 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  39.51 
 
 
444 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  39.42 
 
 
452 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  38.4 
 
 
451 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  38.4 
 
 
457 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  38.27 
 
 
450 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  38.19 
 
 
574 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  37.68 
 
 
438 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  38.18 
 
 
471 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  38.18 
 
 
471 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  38.18 
 
 
470 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  37.56 
 
 
461 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 
455 aa  242  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  35.92 
 
 
460 aa  240  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  38.78 
 
 
503 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  37.14 
 
 
455 aa  234  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  37.44 
 
 
486 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  40.39 
 
 
474 aa  232  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
446 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  37.72 
 
 
433 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  37.66 
 
 
443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  33.77 
 
 
490 aa  221  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  38.42 
 
 
438 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  36.92 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  38.86 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.39 
 
 
437 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  37.1 
 
 
451 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  33.67 
 
 
446 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
451 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  31.11 
 
 
451 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
451 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  29.67 
 
 
435 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  29.67 
 
 
435 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  29.67 
 
 
435 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  29.67 
 
 
435 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  34.36 
 
 
443 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  30.93 
 
 
443 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  29.35 
 
 
435 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
435 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
435 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  37.56 
 
 
439 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  36.67 
 
 
445 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  29.35 
 
 
444 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30.85 
 
 
451 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  30.85 
 
 
435 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.12 
 
 
446 aa  203  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  36.09 
 
 
453 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  29.1 
 
 
435 aa  203  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  29.95 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  36.93 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  30.13 
 
 
477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  29.53 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  29.28 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  29.64 
 
 
443 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  30.73 
 
 
432 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  31.59 
 
 
439 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  28.79 
 
 
428 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  30.48 
 
 
432 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  30.48 
 
 
432 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  30.48 
 
 
432 aa  193  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  29.82 
 
 
440 aa  193  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  30.02 
 
 
432 aa  193  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.23 
 
 
432 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  30.73 
 
 
432 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  35.48 
 
 
453 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  34.51 
 
 
442 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  31.31 
 
 
441 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.83 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  30.51 
 
 
440 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.1 
 
 
425 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  30.54 
 
 
437 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.82 
 
 
442 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.41 
 
 
442 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.41 
 
 
442 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.67 
 
 
442 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>