More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0412 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
459 aa  897    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  71.65 
 
 
458 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  71.43 
 
 
458 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  71.43 
 
 
458 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  67.1 
 
 
453 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  69.3 
 
 
455 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  66.45 
 
 
450 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  63.84 
 
 
469 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  64.08 
 
 
478 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  61.96 
 
 
464 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  57.62 
 
 
496 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  60.44 
 
 
451 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  59.74 
 
 
462 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  58.01 
 
 
460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  55.08 
 
 
456 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3861  protein of unknown function DUF21  61.36 
 
 
460 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00340007  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  48.79 
 
 
520 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  48.78 
 
 
452 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  47.88 
 
 
452 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  51.49 
 
 
486 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  46.55 
 
 
441 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  44.9 
 
 
451 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  43.42 
 
 
451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  49.52 
 
 
468 aa  298  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  39.22 
 
 
444 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  38.86 
 
 
470 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  38.86 
 
 
471 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  38.86 
 
 
471 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  37.81 
 
 
451 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  38.41 
 
 
461 aa  263  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  37.59 
 
 
457 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 
450 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  37.89 
 
 
455 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  40.33 
 
 
452 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  37.75 
 
 
574 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 
438 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  35.97 
 
 
455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  35.97 
 
 
460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  38.44 
 
 
503 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  35.97 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  35.64 
 
 
490 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  39 
 
 
474 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  38.61 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  36.87 
 
 
451 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 
446 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  38.48 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  36.65 
 
 
453 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  35.09 
 
 
443 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
431 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  36.01 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.51 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.01 
 
 
430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.67 
 
 
446 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  33.67 
 
 
433 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 
438 aa  193  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  32.38 
 
 
443 aa  193  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  32.6 
 
 
438 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  34.84 
 
 
445 aa  193  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31.86 
 
 
446 aa  192  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.41 
 
 
434 aa  189  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.42 
 
 
442 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 
441 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  29.18 
 
 
451 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 
451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  28.93 
 
 
451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 
451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  29.23 
 
 
451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 
442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  28.81 
 
 
428 aa  183  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  30.7 
 
 
439 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  28.91 
 
 
428 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  32.06 
 
 
437 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  36.46 
 
 
453 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  27.64 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  27.64 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  27.64 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  27.64 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  27.86 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  28.86 
 
 
443 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  30.27 
 
 
446 aa  180  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  28.82 
 
 
444 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  29.05 
 
 
428 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  27.86 
 
 
435 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  31.48 
 
 
443 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  27.39 
 
 
435 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  27.39 
 
 
435 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  30.42 
 
 
432 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  30.42 
 
 
432 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  28.02 
 
 
435 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  28.1 
 
 
443 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  30.32 
 
 
441 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  33.5 
 
 
434 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  30.13 
 
 
432 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  28.81 
 
 
428 aa  177  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  31.31 
 
 
443 aa  176  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  28.91 
 
 
477 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  28.02 
 
 
435 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  28.64 
 
 
440 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  29.13 
 
 
448 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>