More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3115 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  909    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  61.28 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  60.6 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  61.76 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  60.19 
 
 		 464 aa  478  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  52.55 
 
 		 458 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  52.55 
 
 		 458 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  52.55 
 
 		 458 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  53.66 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  54.87 
 
 		 451 aa  448  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  54.35 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  55.7 
 
 		 459 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  53.85 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  51.24 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  48.69 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3861  protein of unknown function DUF21  53.79 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00340007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  46.37 
 
 		 452 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  45.86 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  44.02 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  42.76 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  43.53 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  43.46 
 
 		 486 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  40.84 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  42.19 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  35.11 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  39.22 
 
 		 474 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 		 438 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  37.35 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  36.61 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  37 
 
 		 574 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  34.8 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  35.76 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  36.41 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  35.76 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  35.76 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  36.23 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  34.73 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  36.52 
 
 		 486 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  35.55 
 
 		 503 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  34.67 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  34.79 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  34.63 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.16 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  35.01 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  34.07 
 
 		 490 aa  204  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  35.14 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.32 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  31.55 
 
 		 443 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  30.98 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  30.28 
 
 		 430 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  34.76 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  33.75 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  31.22 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  31.84 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  29.74 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  29.74 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  29.74 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  29.74 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  29.74 
 
 		 435 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  29.74 
 
 		 435 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  29.49 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  29.85 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  31.35 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  29.49 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  32.43 
 
 		 431 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  30.63 
 
 		 440 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  30.45 
 
 		 446 aa  176  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  34.01 
 
 		 439 aa  176  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  30.34 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  28.61 
 
 		 451 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.26 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  30.69 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  28.4 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  27.04 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.13 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  30.38 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.13 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  29.16 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.13 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  29.16 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  29.16 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  30.18 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  31.55 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  31.44 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.13 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  29.87 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.13 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  33.24 
 
 		 353 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  30.71 
 
 		 432 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  32.49 
 
 		 464 aa  173  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.13 
 
 		 442 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  29.67 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  29.78 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  29.23 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  29.23 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  28.57 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>