More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2371 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
490 aa  988    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  58.57 
 
 
455 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  57.68 
 
 
460 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  47.35 
 
 
574 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  50.24 
 
 
503 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  47.43 
 
 
450 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  45.2 
 
 
486 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  48.51 
 
 
444 aa  347  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  47.11 
 
 
451 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  41.06 
 
 
438 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  43.61 
 
 
457 aa  324  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  43.38 
 
 
451 aa  323  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  46.26 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  42.47 
 
 
450 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  44.01 
 
 
439 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  43.44 
 
 
471 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  43.44 
 
 
471 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  43.44 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  43.14 
 
 
452 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  41.14 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  41.23 
 
 
455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  41.11 
 
 
461 aa  303  5.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  42.13 
 
 
443 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  42.64 
 
 
453 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  43.14 
 
 
452 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  41.18 
 
 
445 aa  292  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  44.56 
 
 
451 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  42.44 
 
 
474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  42.09 
 
 
438 aa  289  9e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  37.67 
 
 
442 aa  280  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  38.37 
 
 
520 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  39.37 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  38.24 
 
 
452 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  36.64 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  36.56 
 
 
486 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  36.69 
 
 
462 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  34.7 
 
 
441 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  34.02 
 
 
451 aa  233  8.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  32.95 
 
 
446 aa  230  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  33 
 
 
438 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  30.87 
 
 
446 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  33.77 
 
 
458 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  33.77 
 
 
458 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  33.77 
 
 
458 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.43 
 
 
446 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  38.77 
 
 
468 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  34.98 
 
 
453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  35.87 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  36.21 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  35.96 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.28 
 
 
434 aa  210  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.84 
 
 
437 aa  210  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  35.63 
 
 
451 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  34.9 
 
 
455 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  35.09 
 
 
496 aa  206  8e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.39 
 
 
442 aa  205  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  36.02 
 
 
478 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.02 
 
 
442 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  32.1 
 
 
444 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  33 
 
 
443 aa  200  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  30.93 
 
 
444 aa  200  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  29.78 
 
 
446 aa  200  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  28.89 
 
 
442 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  28.89 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  28.67 
 
 
442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  31.03 
 
 
430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  28.44 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  30.6 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  31.92 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 
449 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  28.22 
 
 
442 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  28.44 
 
 
442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30.6 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  30.77 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  28.44 
 
 
442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  28.44 
 
 
440 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.49 
 
 
428 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  30.77 
 
 
443 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  28 
 
 
442 aa  196  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  28.22 
 
 
442 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  30.96 
 
 
439 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  27.25 
 
 
449 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  27.25 
 
 
449 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  30.54 
 
 
443 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  30.54 
 
 
443 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28.73 
 
 
435 aa  193  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  28.73 
 
 
435 aa  193  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28.73 
 
 
435 aa  193  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28.73 
 
 
435 aa  193  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  28.51 
 
 
435 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  28.51 
 
 
435 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  28.41 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  28.29 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  31.14 
 
 
433 aa  189  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  34.21 
 
 
450 aa  189  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  33.75 
 
 
456 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  32.63 
 
 
432 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  29.49 
 
 
451 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>