50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2455 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  36.69 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  36 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  36.86 
 
 		 268 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  36.86 
 
 		 268 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  36.59 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  36.43 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  32.86 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  35.93 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  34.3 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  34.3 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  34.1 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  34.04 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  35.91 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  34.73 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  32.59 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  32.97 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  31.18 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  31.54 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  32.39 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  31.91 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  31.29 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  31.91 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  33.46 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  31.01 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  27.04 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  33.45 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  33.71 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  32.58 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  33.59 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  29.01 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  28.68 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  30.6 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  31.99 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  30.08 
 
 		 256 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  28.42 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  28.29 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  26.91 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  26 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  26.4 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  26 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  24.51 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  26.34 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  26.09 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  34.15 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  28.3 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  28.3 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  28.3 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  23.99 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  25.38 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>