174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2796 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  100 
 
 		 696 aa  1404    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  30.59 
 
 		 692 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  29.35 
 
 		 680 aa  292  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  32.63 
 
 		 741 aa  273  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  30.47 
 
 		 710 aa  265  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  30.47 
 
 		 710 aa  265  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  32.74 
 
 		 705 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  29.65 
 
 		 652 aa  253  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  24.25 
 
 		 685 aa  249  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.3 
 
 		 661 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  29.6 
 
 		 674 aa  223  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  27.7 
 
 		 648 aa  200  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  26.54 
 
 		 516 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  26.63 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  26.24 
 
 		 612 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  23.92 
 
 		 651 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  23.92 
 
 		 651 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  25.58 
 
 		 655 aa  182  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  26.24 
 
 		 701 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.78 
 
 		 709 aa  177  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.67 
 
 		 714 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.01 
 
 		 646 aa  172  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  25.47 
 
 		 681 aa  168  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  25.48 
 
 		 701 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.9 
 
 		 625 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  24.95 
 
 		 517 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  24.77 
 
 		 663 aa  142  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  25.2 
 
 		 646 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  26.06 
 
 		 646 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  25.2 
 
 		 646 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  25.2 
 
 		 646 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  26.26 
 
 		 646 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  25.2 
 
 		 646 aa  138  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.7 
 
 		 628 aa  137  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  24.61 
 
 		 646 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  25.34 
 
 		 646 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  24.95 
 
 		 646 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  22.11 
 
 		 656 aa  136  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  25.12 
 
 		 638 aa  136  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  25.54 
 
 		 643 aa  135  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.65 
 
 		 627 aa  128  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.35 
 
 		 703 aa  127  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  25.05 
 
 		 678 aa  126  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  24.17 
 
 		 698 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  24.17 
 
 		 698 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.31 
 
 		 641 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.62 
 
 		 683 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  24.62 
 
 		 637 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1524  transcriptional antiterminator, BglG  27.16 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000100792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  24.46 
 
 		 637 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.38 
 
 		 705 aa  118  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  24.69 
 
 		 636 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.54 
 
 		 636 aa  119  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  24.46 
 
 		 637 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  24.46 
 
 		 637 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  24.31 
 
 		 637 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0028  transcriptional antiterminator  24.02 
 
 		 644 aa  117  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.54 
 
 		 696 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  23.4 
 
 		 496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  22.54 
 
 		 698 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  22.37 
 
 		 689 aa  109  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  22.41 
 
 		 668 aa  107  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  24.42 
 
 		 684 aa  103  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  21.51 
 
 		 710 aa  103  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  21.68 
 
 		 688 aa  103  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  21.13 
 
 		 687 aa  103  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  22.96 
 
 		 685 aa  99.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  22.47 
 
 		 642 aa  99  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  22.77 
 
 		 623 aa  97.4  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.59 
 
 		 712 aa  96.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  22.47 
 
 		 639 aa  89  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  21.67 
 
 		 557 aa  89.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  23.03 
 
 		 559 aa  89  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0060  capsule synthesis trans-acting positive regulator, putative  22.44 
 
 		 482 aa  87.4  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13268  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  23.97 
 
 		 624 aa  84  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  23.97 
 
 		 624 aa  84  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  28.9 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  25.82 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  25.35 
 
 		 282 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  27.03 
 
 		 282 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  29.15 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1739  transcriptional antiterminator  27.27 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000739746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0655  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  18.46 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  19.02 
 
 		 670 aa  68.6  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0084  capsule synthesis trans-acting positive regulator  22.22 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.905304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3639  transcriptional antiterminator, BglG  20.46 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3443  transcriptional antiterminator, BglG  21.48 
 
 		 481 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  22.17 
 
 		 285 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  25 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  24.8 
 
 		 282 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  26.13 
 
 		 282 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  24.59 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  25.58 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  26.13 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  26.13 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  24.31 
 
 		 276 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  24.46 
 
 		 280 aa  57  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  23.5 
 
 		 279 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  25.85 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  25.85 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>