108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3555 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  100 
 
 
712 aa  1407    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  42.43 
 
 
703 aa  535  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  32.73 
 
 
710 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  32.77 
 
 
678 aa  306  8.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  29.74 
 
 
681 aa  300  8e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  29.84 
 
 
698 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  31.99 
 
 
683 aa  280  8e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  30.66 
 
 
689 aa  278  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  30.32 
 
 
685 aa  257  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  30.06 
 
 
705 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  31.32 
 
 
687 aa  253  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  30.32 
 
 
684 aa  251  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.94 
 
 
705 aa  242  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  29.02 
 
 
688 aa  242  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.33 
 
 
696 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  29.96 
 
 
557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  26.85 
 
 
642 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.86 
 
 
714 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.46 
 
 
709 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.07 
 
 
670 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  26.91 
 
 
701 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  25.17 
 
 
741 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  26.28 
 
 
701 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  26.59 
 
 
612 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  28.41 
 
 
652 aa  140  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  24.13 
 
 
651 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  24.13 
 
 
651 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  26.84 
 
 
668 aa  113  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  25.39 
 
 
692 aa  111  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.54 
 
 
661 aa  101  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  21.85 
 
 
698 aa  99  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  21.85 
 
 
698 aa  99  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.59 
 
 
696 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  26.41 
 
 
655 aa  98.2  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  26.36 
 
 
663 aa  95.9  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  27.54 
 
 
646 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  26.73 
 
 
646 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  21.3 
 
 
639 aa  87.4  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  26.65 
 
 
646 aa  87  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  22.41 
 
 
648 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  26.65 
 
 
646 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  26.85 
 
 
646 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  26.65 
 
 
646 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  25.94 
 
 
646 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  26.65 
 
 
646 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  22.35 
 
 
710 aa  85.1  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  22.35 
 
 
710 aa  85.1  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  25.93 
 
 
646 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  25.74 
 
 
643 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  25.05 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  21.93 
 
 
680 aa  79  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  23.49 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  23.35 
 
 
516 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.88 
 
 
627 aa  75.1  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  28.77 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3368  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.94 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  21.96 
 
 
637 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  21.96 
 
 
637 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  21.96 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  21.84 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  21.96 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  23.13 
 
 
559 aa  66.2  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  24.53 
 
 
624 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  24.53 
 
 
624 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.01 
 
 
625 aa  64.7  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  22.41 
 
 
685 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1524  transcriptional antiterminator, BglG  20.28 
 
 
513 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000100792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  21.43 
 
 
638 aa  60.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.88 
 
 
636 aa  61.2  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  20.28 
 
 
623 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2750  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.25 
 
 
143 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3188  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.7 
 
 
151 aa  59.7  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192348  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1810  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.28 
 
 
144 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1737  phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain-containing protein  35.23 
 
 
151 aa  53.5  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0128  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.41 
 
 
146 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0591  PTS system, IIA component, putative  28.47 
 
 
149 aa  52.8  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0380  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.95 
 
 
147 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0390  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  30.95 
 
 
147 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0117  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.66 
 
 
158 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0354562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0290  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.53 
 
 
158 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0901899  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1150  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.5 
 
 
138 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  22.95 
 
 
656 aa  52.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0984  PTS system, IIA component  25.17 
 
 
168 aa  52  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1286  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.48 
 
 
151 aa  51.2  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0501  PTS system L-ascorbate family IIA subunit  29.01 
 
 
147 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.114156  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1267  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  22.83 
 
 
149 aa  50.4  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0108349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0489  putative PTS system enzyme IIA component protein  31.53 
 
 
147 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3075  putative mannitol phosphotransferase subunit EIIA  31.87 
 
 
147 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.71 
 
 
641 aa  50.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3520  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.12 
 
 
147 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.431164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  25.73 
 
 
636 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2491  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  38.24 
 
 
144 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0779961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02764  predicted mannitol-specific enzyme IIA component of PTS  31.87 
 
 
138 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0760  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.87 
 
 
147 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3268  putative mannitol phosphotransferase subunit EIIA  31.87 
 
 
147 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0777  putative mannitol phosphotransferase subunit EIIA  31.87 
 
 
147 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0176626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3366  putative mannitol phosphotransferase subunit EIIA  31.87 
 
 
147 aa  48.9  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4235  putative mannitol phosphotransferase subunit EIIA  31.87 
 
 
147 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1464  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.32 
 
 
149 aa  48.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1483  phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain-containing protein  30.61 
 
 
160 aa  47.8  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.445429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>