43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_pXO2_0084 on replicon NC_007323
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007323  GBAA_pXO2_0084  capsule synthesis trans-acting positive regulator  100 
 
 
483 aa  969    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.905304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3639  transcriptional antiterminator, BglG  77.64 
 
 
480 aa  766    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3443  transcriptional antiterminator, BglG  71.25 
 
 
481 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0060  capsule synthesis trans-acting positive regulator, putative  40.21 
 
 
482 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13268  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0146  transcriptional activator AtxA  26.43 
 
 
475 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0901099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  25.15 
 
 
646 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  24.18 
 
 
646 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  24.66 
 
 
646 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  24.66 
 
 
646 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  24.66 
 
 
646 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  24.47 
 
 
646 aa  94.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  24.46 
 
 
646 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  24.66 
 
 
646 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  24.85 
 
 
646 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  24.31 
 
 
643 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  23.97 
 
 
652 aa  83.6  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.22 
 
 
696 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  24.36 
 
 
705 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0797  hypothetical protein  80.49 
 
 
64 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.02 
 
 
625 aa  68.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.5 
 
 
661 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  18.92 
 
 
638 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  20.61 
 
 
516 aa  57  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  23.53 
 
 
741 aa  57  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25 
 
 
627 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  19.38 
 
 
637 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  19.38 
 
 
637 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  19.38 
 
 
637 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  19.38 
 
 
637 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  31.85 
 
 
496 aa  51.6  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  19.55 
 
 
637 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  21.27 
 
 
685 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  19.65 
 
 
648 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  19.57 
 
 
651 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  19.57 
 
 
651 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  26.57 
 
 
663 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.48 
 
 
714 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  19.6 
 
 
517 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  26.23 
 
 
680 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.52 
 
 
683 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  24.71 
 
 
685 aa  45.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  17.38 
 
 
641 aa  43.5  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  19.11 
 
 
636 aa  43.1  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>