140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0235 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
698 aa  1437    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  100 
 
 
698 aa  1437    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  28.59 
 
 
701 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  27.77 
 
 
701 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.28 
 
 
714 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.25 
 
 
709 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  26.06 
 
 
705 aa  208  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  27.18 
 
 
612 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  28.32 
 
 
639 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  25.46 
 
 
668 aa  176  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  23.59 
 
 
741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  26.93 
 
 
710 aa  140  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.03 
 
 
705 aa  135  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  23.28 
 
 
651 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  23.28 
 
 
651 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.17 
 
 
696 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  24.56 
 
 
681 aa  128  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  27.23 
 
 
652 aa  127  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.03 
 
 
703 aa  126  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  21.53 
 
 
688 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.17 
 
 
696 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  23.86 
 
 
692 aa  124  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  21.99 
 
 
687 aa  122  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  22.3 
 
 
698 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.94 
 
 
683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  21.89 
 
 
685 aa  115  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  22.3 
 
 
689 aa  114  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1739  transcriptional antiterminator  25.67 
 
 
470 aa  107  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000739746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.95 
 
 
661 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  22.84 
 
 
678 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  23.08 
 
 
680 aa  104  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  26.5 
 
 
646 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  22.01 
 
 
684 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  25.93 
 
 
646 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  26.21 
 
 
646 aa  101  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  23.5 
 
 
646 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.84 
 
 
670 aa  100  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  25.85 
 
 
646 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  24.62 
 
 
643 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  25.64 
 
 
646 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  25.64 
 
 
646 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  25.64 
 
 
646 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  25.21 
 
 
646 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.34 
 
 
712 aa  95.1  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.8 
 
 
628 aa  92.4  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.36 
 
 
627 aa  88.6  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  23.6 
 
 
559 aa  86.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  22.59 
 
 
648 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  20.81 
 
 
638 aa  86.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  20.61 
 
 
655 aa  84.3  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  22.73 
 
 
642 aa  82.8  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  23.6 
 
 
557 aa  81.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22 
 
 
636 aa  78.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  22.48 
 
 
710 aa  77.4  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  22.48 
 
 
710 aa  77.4  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  23.59 
 
 
656 aa  77.4  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  28.95 
 
 
674 aa  77  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.62 
 
 
641 aa  74.3  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  21.71 
 
 
516 aa  74.3  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  22.84 
 
 
637 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  22.01 
 
 
637 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  22.56 
 
 
637 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  22.56 
 
 
637 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  22.56 
 
 
637 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  21.25 
 
 
516 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  22.32 
 
 
685 aa  71.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  20.44 
 
 
636 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.45 
 
 
625 aa  64.3  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  20.22 
 
 
517 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3368  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.2 
 
 
143 aa  62  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2983  hypothetical protein  37.89 
 
 
102 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000183001  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  22.69 
 
 
496 aa  62.4  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1150  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.62 
 
 
138 aa  62  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1464  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.21 
 
 
149 aa  60.8  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  17.39 
 
 
646 aa  61.2  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1524  transcriptional antiterminator, BglG  20.3 
 
 
513 aa  60.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000100792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  22.53 
 
 
421 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1737  phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain-containing protein  27.97 
 
 
151 aa  58.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.108032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1408  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.13 
 
 
147 aa  57.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.808256  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3321  putative mannitol phosphotransferase subunit EIIA  22.22 
 
 
147 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3254  putative mannitol phosphotransferase subunit EIIA  22.22 
 
 
147 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0489  putative PTS system enzyme IIA component protein  29.37 
 
 
147 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0984  PTS system, IIA component  28.95 
 
 
168 aa  55.1  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0825  putative phosphotransferase enzyme II, A component  26.56 
 
 
149 aa  54.7  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.212876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3798  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.71 
 
 
154 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1813  PTS system, IIA component  24.41 
 
 
161 aa  53.5  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0501  PTS system L-ascorbate family IIA subunit  28.57 
 
 
147 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.114156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5711  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  25.71 
 
 
154 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0380  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.27 
 
 
147 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0390  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  27.27 
 
 
147 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3818  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  25 
 
 
154 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5269  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  25.9 
 
 
153 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2933  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24 
 
 
147 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4666  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  27.56 
 
 
154 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3188  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.68 
 
 
151 aa  52.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2491  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24 
 
 
144 aa  52.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0779961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  25.41 
 
 
624 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  25.41 
 
 
624 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0117  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  23.53 
 
 
158 aa  52  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0354562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4755  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIA  22.63 
 
 
154 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>